Applications of Aminoacylation Ribozymes That Recognize the 3′-end of tRNA / Terasaka, Naohiro  

Público ISBD Ningún comentario para este título. Título : Applications of Aminoacylation Ribozymes That Recognize the 3′-end of tRNA Tipo de documento: documento electrónico Autores: Terasaka, Naohiro, Mención de edición: 1 ed. Editorial: Tokyo [Japón] : Springer Fecha de publicación: 2017 Número de páginas: XII, 89 p. 38 ilustraciones, 28 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-4-431-56517-8 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Química bioorgánica  Catálisis  Biomateriales  Ácidos nucleicos  Biotecnología  Ácido nucleico Clasificación: 547 Resumen: En esta tesis se describen aplicaciones de ribozimas de aminoacilación denominadas flexizimas. Las flexizimas tienen las siguientes características únicas: (i) el ARN sustrato es reconocido por dos pares de bases consecutivos entre el extremo 3'' del ARN sustrato y el extremo 3'' de la flexizima; (ii) estos pares de bases pueden sustituirse por otros pares de bases; y (iii) se pueden usar varios aminoácidos activados como sustratos, incluidos aminoácidos tanto canónicos como no canónicos. Esta aminoacilación flexible de ARN mediante flexizimas se utilizó para marcar los ARNt endógenos que se eliminarían, y la selección in vitro utilizando la biblioteca agotada de ARNt permitió el descubrimiento de la nueva interacción entre el precursor de microARN y los metabolitos. Las flexizimas también se utilizan para preparar varios aminoacil-ARNt que contienen mutaciones en el extremo 3'' para diseñar la maquinaria de traducción y desarrollar la maquinaria de traducción ortogonal. La primera parte de la investigación demostró que SELEX es apropiado para descubrir la interacción entre ARN pequeños y ligandos, y sugirió que en los ARN pequeños existe una mayor unión de motivos de ARN a moléculas pequeñas. La segunda parte abrió la puerta a nuevas oportunidades para la biología sintética in vitro que implican la ingeniería de códigos genéticos y maquinarias de traducción. Esta investigación también indicó el gran potencial de la aminoacilación mediante flexizimas para su aplicación en diversos campos de la investigación del ARN, lo que resulta beneficioso para los investigadores del ARN. Nota de contenido: General introduction -- Discovery of human microRNA precursor binding to folic acid by small RNA transcriptomic SELEX -- Orthogonal ribosome-tRNAs pair by engineering of peptidyl transferase center -- General conclusion. Tipo de medio : Computadora Summary : In this thesis, applications of aminoacylation ribozymes named flexizymes are described. Flexizymes have the following unique characteristics: (i) substrate RNA is recognized by two consecutive base pairs between the 3'-end of substrate RNA and the 3'-end of the flexizyme; (ii) these base pairs can be substituted with other base pairs; and (iii) various activated amino acids can be used as substrates including both canonical and noncanonical amino acids. This flexible aminoacylation of RNAs by flexizymes was used to label endogenous tRNAs to be removed, and in vitro selection using the tRNA-depleted library enabled the discovery of the novel interaction between the microRNA precursor and metabolites. Flexizymes are also used to prepare various aminoacyl-tRNAs bearing mutations at the 3'-end to engineer the translation machinery and to develop the orthogonal translation machinery. The first part of the research demonstrated that SELEX is appropriate for discovering the interaction between small RNA and ligands, and suggested that more RNA motif binding to small molecules exists in small RNAs. The second part opened a door to new opportunities for in vitro synthetic biology involving the engineering of the genetic codes and translation machineries. This research also indicated the great potential of aminoacylation by flexizymes to be applied in various fields of RNA research, which is beneficial for RNA researchers. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Applications of Aminoacylation Ribozymes That Recognize the 3′-end of tRNA [documento electrónico] / Terasaka, Naohiro,  . -  1 ed.  . - Tokyo [Japón] : Springer, 2017 . - XII, 89 p. 38 ilustraciones, 28 ilustraciones en color. ISBN : 978-4-431-56517-8 Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Química bioorgánica  Catálisis  Biomateriales  Ácidos nucleicos  Biotecnología  Ácido nucleico Clasificación: 547 Resumen: En esta tesis se describen aplicaciones de ribozimas de aminoacilación denominadas flexizimas. Las flexizimas tienen las siguientes características únicas: (i) el ARN sustrato es reconocido por dos pares de bases consecutivos entre el extremo 3'' del ARN sustrato y el extremo 3'' de la flexizima; (ii) estos pares de bases pueden sustituirse por otros pares de bases; y (iii) se pueden usar varios aminoácidos activados como sustratos, incluidos aminoácidos tanto canónicos como no canónicos. Esta aminoacilación flexible de ARN mediante flexizimas se utilizó para marcar los ARNt endógenos que se eliminarían, y la selección in vitro utilizando la biblioteca agotada de ARNt permitió el descubrimiento de la nueva interacción entre el precursor de microARN y los metabolitos. Las flexizimas también se utilizan para preparar varios aminoacil-ARNt que contienen mutaciones en el extremo 3'' para diseñar la maquinaria de traducción y desarrollar la maquinaria de traducción ortogonal. La primera parte de la investigación demostró que SELEX es apropiado para descubrir la interacción entre ARN pequeños y ligandos, y sugirió que en los ARN pequeños existe una mayor unión de motivos de ARN a moléculas pequeñas. La segunda parte abrió la puerta a nuevas oportunidades para la biología sintética in vitro que implican la ingeniería de códigos genéticos y maquinarias de traducción. Esta investigación también indicó el gran potencial de la aminoacilación mediante flexizimas para su aplicación en diversos campos de la investigación del ARN, lo que resulta beneficioso para los investigadores del ARN. Nota de contenido: General introduction -- Discovery of human microRNA precursor binding to folic acid by small RNA transcriptomic SELEX -- Orthogonal ribosome-tRNAs pair by engineering of peptidyl transferase center -- General conclusion. Tipo de medio : Computadora Summary : In this thesis, applications of aminoacylation ribozymes named flexizymes are described. Flexizymes have the following unique characteristics: (i) substrate RNA is recognized by two consecutive base pairs between the 3'-end of substrate RNA and the 3'-end of the flexizyme; (ii) these base pairs can be substituted with other base pairs; and (iii) various activated amino acids can be used as substrates including both canonical and noncanonical amino acids. This flexible aminoacylation of RNAs by flexizymes was used to label endogenous tRNAs to be removed, and in vitro selection using the tRNA-depleted library enabled the discovery of the novel interaction between the microRNA precursor and metabolites. Flexizymes are also used to prepare various aminoacyl-tRNAs bearing mutations at the 3'-end to engineer the translation machinery and to develop the orthogonal translation machinery. The first part of the research demonstrated that SELEX is appropriate for discovering the interaction between small RNA and ligands, and suggested that more RNA motif binding to small molecules exists in small RNAs. The second part opened a door to new opportunities for in vitro synthetic biology involving the engineering of the genetic codes and translation machineries. This research also indicated the great potential of aminoacylation by flexizymes to be applied in various fields of RNA research, which is beneficial for RNA researchers. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]

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