Autor Chandran, Anandhakumar
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Título : Advancing Development of Synthetic Gene Regulators : With the Power of High-Throughput Sequencing in Chemical Biology Tipo de documento: documento electrónico Autores: Chandran, Anandhakumar, Autor Mención de edición: 1 ed. Editorial: Singapore [Malasya] : Springer Fecha de publicación: 2018 Número de páginas: XV, 114 p. 49 ilustraciones, 44 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-981-10-6547-7 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Palabras clave: Biotecnología Genética Médica Química bioorgánica Genética clínica Índice Dewey: 660.6 Biotecnología Resumen: Este libro se centra en una noción innovadora que utiliza las poderosas aplicaciones de las tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS) en la interfaz de la química y la biología. En la medicina personalizada, desarrollar pequeñas moléculas dirigidas a una secuencia genómica específica es un objetivo atractivo. Las poliamidas (PIP) de N-metilpirrol (P) –N-metilimidazol (I) son una clase de molécula pequeña que puede unirse al surco menor del ADN. En primer lugar, se desarrolló un Bind-n-Seq basado en NGS (plataforma de torrentes de iones) rentable para identificar la especificidad de unión de los conjugados PIP en una biblioteca de ADN aleatoria. Sus influencias biológicas dependen principalmente de la afinidad de unión selectiva al ADN, por lo que es importante analizar sus preferencias de unión en todo el genoma. Sin embargo, es exigente enriquecer específicamente el ADN unido a moléculas pequeñas sin entrecruzamiento químico ni unión covalente en genomas cromatizados. En este documento se describe un método que se desarrolló utilizando secuenciación de alto rendimiento para mapear los sitios de unión diferenciales y las regiones enriquecidas relativas de SAHA-PIP no reticuladas en todo el complejo genoma humano. Se identificaron motivos de unión de SAHA-PIP y el mapeo a nivel del genoma de las regiones enriquecidas con SAHA-PIP proporcionó evidencia de la activación diferencial de la red de genes. También se desarrolló un método que utiliza secuenciación de alto rendimiento para mapear los sitios de unión y las regiones relativamente enriquecidas de PIP alquilante en todo el genoma humano. El mapeo a nivel del genoma de la alquilación de la región enriquecida en PIP y los sitios de unión en el genoma humano identifica objetivos genómicos importantes del cáncer de mama. Se anticipa que esta investigación pionera, de bajo costo y alto rendimiento a nivel de secuencia específica será útil para comprender la especificidad de unión de varias moléculas pequeñas que se unen al ADN, lo que a su vez será beneficioso para el desarrollo de moléculas pequeñas. Medicamentos basados en una secuencia a nivel del genoma. . Nota de contenido: Overview of Next-Generation Sequencing Technologies and its application in Chemical Biology -- Next Generation Sequencing Studies Guide the Design of Pyrrole-Imidazole Polyamides with Improved Binding Specificity by the Addition of β-alanine -- Genome-Wide Assessment of the Binding Effects of Artificial Transcriptional Activators by Utilizing the Power of High-Throughput Sequencing -- Deciphering the genomic targets of alkylating polyamide conjugates using high-throughput sequencing. En línea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i Advancing Development of Synthetic Gene Regulators : With the Power of High-Throughput Sequencing in Chemical Biology [documento electrónico] / Chandran, Anandhakumar, Autor . - 1 ed. . - Singapore [Malasya] : Springer, 2018 . - XV, 114 p. 49 ilustraciones, 44 ilustraciones en color.
ISBN : 978-981-10-6547-7
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Palabras clave: Biotecnología Genética Médica Química bioorgánica Genética clínica Índice Dewey: 660.6 Biotecnología Resumen: Este libro se centra en una noción innovadora que utiliza las poderosas aplicaciones de las tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS) en la interfaz de la química y la biología. En la medicina personalizada, desarrollar pequeñas moléculas dirigidas a una secuencia genómica específica es un objetivo atractivo. Las poliamidas (PIP) de N-metilpirrol (P) –N-metilimidazol (I) son una clase de molécula pequeña que puede unirse al surco menor del ADN. En primer lugar, se desarrolló un Bind-n-Seq basado en NGS (plataforma de torrentes de iones) rentable para identificar la especificidad de unión de los conjugados PIP en una biblioteca de ADN aleatoria. Sus influencias biológicas dependen principalmente de la afinidad de unión selectiva al ADN, por lo que es importante analizar sus preferencias de unión en todo el genoma. Sin embargo, es exigente enriquecer específicamente el ADN unido a moléculas pequeñas sin entrecruzamiento químico ni unión covalente en genomas cromatizados. En este documento se describe un método que se desarrolló utilizando secuenciación de alto rendimiento para mapear los sitios de unión diferenciales y las regiones enriquecidas relativas de SAHA-PIP no reticuladas en todo el complejo genoma humano. Se identificaron motivos de unión de SAHA-PIP y el mapeo a nivel del genoma de las regiones enriquecidas con SAHA-PIP proporcionó evidencia de la activación diferencial de la red de genes. También se desarrolló un método que utiliza secuenciación de alto rendimiento para mapear los sitios de unión y las regiones relativamente enriquecidas de PIP alquilante en todo el genoma humano. El mapeo a nivel del genoma de la alquilación de la región enriquecida en PIP y los sitios de unión en el genoma humano identifica objetivos genómicos importantes del cáncer de mama. Se anticipa que esta investigación pionera, de bajo costo y alto rendimiento a nivel de secuencia específica será útil para comprender la especificidad de unión de varias moléculas pequeñas que se unen al ADN, lo que a su vez será beneficioso para el desarrollo de moléculas pequeñas. Medicamentos basados en una secuencia a nivel del genoma. . Nota de contenido: Overview of Next-Generation Sequencing Technologies and its application in Chemical Biology -- Next Generation Sequencing Studies Guide the Design of Pyrrole-Imidazole Polyamides with Improved Binding Specificity by the Addition of β-alanine -- Genome-Wide Assessment of the Binding Effects of Artificial Transcriptional Activators by Utilizing the Power of High-Throughput Sequencing -- Deciphering the genomic targets of alkylating polyamide conjugates using high-throughput sequencing. En línea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i
