7th International Conference, AlCoB 2020, Missoula, MT, USA, April 13–15, 2020, Proceedings / Martín-Vide, Carlos ; Vega-Rodríguez, Miguel A. ; Wheeler, Travis  

Público ISBD Ningún comentario para este título. Título : 7th International Conference, AlCoB 2020, Missoula, MT, USA, April 13–15, 2020, Proceedings Tipo de documento: documento electrónico Autores: Martín-Vide, Carlos, ; Vega-Rodríguez, Miguel A., ; Wheeler, Travis, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2020 Número de páginas: XVIII, 199 p. 111 ilustraciones, 34 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-42266-0 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Bioinformática  Inteligencia artificial  Algoritmos  Ingeniería Informática  Red de computadoras  Ingeniería de software  Biología Computacional y de Sistemas  Ingeniería Informática y Redes  Redes de comunicación informática Clasificación: 570.285 Resumen: Este libro constituye las actas de la 7.ª Conferencia Internacional sobre Algoritmos para Biología Computacional, AlCoB 2020, que estaba prevista para celebrarse en Missoula, MT, EE. UU. en abril de 2020. Debido a la pandemia de corona, la conferencia se pospuso para celebrarse junto con AlCoB 2021. Los 15 artículos completos incluidos en este volumen fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 24 presentaciones. Estaban organizados en secciones temáticas sobre genómica, filogenética y RNA-Seq y otros procesos biológicos. . Nota de contenido: Genomics -- Parallel Generalized Su x Tree Construction for Genomic Data -- A 3.5-Approximation Algorithm for Sorting by Intergenic Transpositions -- Heuristics for Reversal Distance between Genomes with Duplicated Genes -- Extending Maximal Perfect Haplotype Blocks to the Realm of Pangenomics -- Gaps and Runs in Syntenic Alignments -- Phylogenetics -- Comparing Integer Linear Programming to SAT-Solving for Hard Problems in Computational and Systems Biology -- Combining Networks Using Cherry Picking Sequences -- Linear Time Algorithm for Tree-Child Network Containment -- PathOGiST: A Novel Method for Clustering Pathogen Isolates by Combining Multiple Genotyping Signals -- TreeSolve: Rapid Error-Correction of Microbial Gene Trees -- RNA-Seq and Other Biological Processes -- Time Series Adjustment Enhancement of Hierarchical Modeling of Arabidopsis Thaliana Gene Interactions -- BESTox: A Convolutional Neural Network Regression Model Based on Binary-Encoded SMILES for Acute Oral Toxicity Predictionof Chemical Compounds -- Stratified Test Alleviates Batch Effects in Single-Cell Data -- A Topological Data Analysis Approach on Predicting Phenotypes from Gene Expression Data -- BOAssembler: A Bayesian Optimization Framework to Improve RNA-Seq Assembly Performance. Tipo de medio : Computadora Summary : This book constitutes the proceedings of the 7th International Conference on Algorithms for Computational Biology, AlCoB 2020, was planned to be held in Missoula, MT, USA in April 2020. Due to the corona pandemic the conference was postponed to be held together with AlCoB 2021. The 15 full papers included in this volume were carefully reviewed and selected from 24 submissions. They were organized in topical sections on genomics, phylogenetics, and RNA-Seq and other biological processes. . Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] 7th International Conference, AlCoB 2020, Missoula, MT, USA, April 13–15, 2020, Proceedings [documento electrónico] / Martín-Vide, Carlos, ; Vega-Rodríguez, Miguel A., ; Wheeler, Travis,  . -  1 ed.  . - [s.l.] : Springer, 2020 . - XVIII, 199 p. 111 ilustraciones, 34 ilustraciones en color. ISBN : 978-3-030-42266-0 Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Bioinformática  Inteligencia artificial  Algoritmos  Ingeniería Informática  Red de computadoras  Ingeniería de software  Biología Computacional y de Sistemas  Ingeniería Informática y Redes  Redes de comunicación informática Clasificación: 570.285 Resumen: Este libro constituye las actas de la 7.ª Conferencia Internacional sobre Algoritmos para Biología Computacional, AlCoB 2020, que estaba prevista para celebrarse en Missoula, MT, EE. UU. en abril de 2020. Debido a la pandemia de corona, la conferencia se pospuso para celebrarse junto con AlCoB 2021. Los 15 artículos completos incluidos en este volumen fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 24 presentaciones. Estaban organizados en secciones temáticas sobre genómica, filogenética y RNA-Seq y otros procesos biológicos. . Nota de contenido: Genomics -- Parallel Generalized Su x Tree Construction for Genomic Data -- A 3.5-Approximation Algorithm for Sorting by Intergenic Transpositions -- Heuristics for Reversal Distance between Genomes with Duplicated Genes -- Extending Maximal Perfect Haplotype Blocks to the Realm of Pangenomics -- Gaps and Runs in Syntenic Alignments -- Phylogenetics -- Comparing Integer Linear Programming to SAT-Solving for Hard Problems in Computational and Systems Biology -- Combining Networks Using Cherry Picking Sequences -- Linear Time Algorithm for Tree-Child Network Containment -- PathOGiST: A Novel Method for Clustering Pathogen Isolates by Combining Multiple Genotyping Signals -- TreeSolve: Rapid Error-Correction of Microbial Gene Trees -- RNA-Seq and Other Biological Processes -- Time Series Adjustment Enhancement of Hierarchical Modeling of Arabidopsis Thaliana Gene Interactions -- BESTox: A Convolutional Neural Network Regression Model Based on Binary-Encoded SMILES for Acute Oral Toxicity Predictionof Chemical Compounds -- Stratified Test Alleviates Batch Effects in Single-Cell Data -- A Topological Data Analysis Approach on Predicting Phenotypes from Gene Expression Data -- BOAssembler: A Bayesian Optimization Framework to Improve RNA-Seq Assembly Performance. Tipo de medio : Computadora Summary : This book constitutes the proceedings of the 7th International Conference on Algorithms for Computational Biology, AlCoB 2020, was planned to be held in Missoula, MT, USA in April 2020. Due to the corona pandemic the conference was postponed to be held together with AlCoB 2021. The 15 full papers included in this volume were carefully reviewed and selected from 24 submissions. They were organized in topical sections on genomics, phylogenetics, and RNA-Seq and other biological processes. . Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]

8th International Conference, AlCoB 2021, Missoula, MT, USA, June 7–11, 2021, Proceedings / Martín-Vide, Carlos ; Vega-Rodríguez, Miguel A. ; Wheeler, Travis  

Público ISBD Ningún comentario para este título. Título : 8th International Conference, AlCoB 2021, Missoula, MT, USA, June 7–11, 2021, Proceedings Tipo de documento: documento electrónico Autores: Martín-Vide, Carlos, ; Vega-Rodríguez, Miguel A., ; Wheeler, Travis, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2021 Número de páginas: X, 173 p. 50 ilustraciones, 29 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-74432-8 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Estructuras de datos (Informática)  Teoría de la información  Inteligencia artificial  Procesamiento de imágenes  Visión por computador  Informática  Estadistica matematica  Matemáticas discretas  Análisis numérico  Estructuras de datos y teoría de la información  Imágenes por computadora  visión  reconocimiento de patrones y gráficos  Probabilidad y Estadística en Informática  Matemáticas discretas en informática Clasificación: 005.73 Resumen: Este libro constituye las actas de la 8.ª Conferencia Internacional sobre Algoritmos para Biología Computacional, AlCoB 2020, cuya celebración estaba prevista en Missoula, MT, EE. UU. en junio de 2021. Debido a la pandemia de Covid-19, AlCoB 2020 y AlCoB 2021 se fusionaron y celebrados juntos en estas fechas. Las actas de AlCoB 2020 se publicaron como LNBI 12099. Los 12 artículos completos incluidos en este volumen fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 22 presentaciones. Estaban organizados en secciones temáticas sobre genómica, filogenética y RNA-Seq y otros procesos biológicos. El alcance de AlCoB incluye temas de interés teórico o aplicado, a saber: análisis de secuencia; alineación de secuencias; montaje de secuencia; reordenamiento del genoma; hallazgo de motivos regulatorios; reconstrucción de filogenia; comparación de filogenia; predicción de estructuras; genómica compresiva; proteómica: vías moleculares, redes de interacción, análisis de espectrometría de masas; transcriptómica: variantes de empalme, inferencia y cuantificación de isoformas, análisis diferencial; secuenciación de próxima generación: genómica de poblaciones, metagenómica, metatranscriptómica, epigenómica; arquitectura del genoma CD; análisis de microbioma; biología computacional del cáncer; y biología de sistemas. Nota de contenido: Learning Molecular Classes from Small Numbers of Positive Examples Using Graph Grammars -- Can We Replace Reads by Numeric Signatures? Lyndon Fingerprints as Representations of Sequencing Reads for Machine Learning -- Exploiting Variable Sparsity in Computing Equilibria of Biological Dynamical Systems by Triangular Decomposition -- A Recovery Algorithm and Pooling Designs for One-Stage Noisy Group Testing Under the Probabilistic Framework -- Novel Phylogenetic Network Distances Based on Cherry Picking -- Best Match Graphs with Binary Trees -- Scalable and Accurate Phylogenetic Placement Using pplacer-XR -- Comparing Methods for Species Tree Estimation with Gene Duplication and Loss -- Reversal Distance on Genomes with Different Gene Content and Intergenic Regions Information -- Reversals Distance Considering Flexible Intergenic Regions Sizes -- Improved DNA-versus-Protein Homology Search for Protein Fossils -- The Maximum Weight Trace Alignment Merging Problem. Tipo de medio : Computadora Summary : This book constitutes the proceedings of the 8th International Conference on Algorithms for Computational Biology, AlCoB 2020, was planned to be held in Missoula, MT, USA in June 2021. Due to the Covid-19 pandemic, AlCoB 2020 and AlCoB 2021 were merged and held on these dates together. AlCoB 2020 proceedings were published as LNBI 12099. The 12 full papers included in this volume were carefully reviewed and selected from 22 submissions. They were organized in topical sections on genomics, phylogenetics, and RNA-Seq and other biological processes. The scope of AlCoB includes topics of either theoretical or applied interest, namely: sequence analysis; sequence alignment; sequence assembly; genome rearrangement; regulatory motif finding; phylogeny reconstruction; phylogeny comparison; structure prediction; compressive genomics; proteomics: molecular pathways, interaction networks, mass spectrometry analysis; transcriptomics: splicing variants, isoform inference and quantification, differential analysis; next-generation sequencing: population genomics, metagenomics, metatranscriptomics, epigenomics; genome CD architecture; microbiome analysis; cancer computational biology; and systems biology. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] 8th International Conference, AlCoB 2021, Missoula, MT, USA, June 7–11, 2021, Proceedings [documento electrónico] / Martín-Vide, Carlos, ; Vega-Rodríguez, Miguel A., ; Wheeler, Travis,  . -  1 ed.  . - [s.l.] : Springer, 2021 . - X, 173 p. 50 ilustraciones, 29 ilustraciones en color. ISBN : 978-3-030-74432-8 Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Estructuras de datos (Informática)  Teoría de la información  Inteligencia artificial  Procesamiento de imágenes  Visión por computador  Informática  Estadistica matematica  Matemáticas discretas  Análisis numérico  Estructuras de datos y teoría de la información  Imágenes por computadora  visión  reconocimiento de patrones y gráficos  Probabilidad y Estadística en Informática  Matemáticas discretas en informática Clasificación: 005.73 Resumen: Este libro constituye las actas de la 8.ª Conferencia Internacional sobre Algoritmos para Biología Computacional, AlCoB 2020, cuya celebración estaba prevista en Missoula, MT, EE. UU. en junio de 2021. Debido a la pandemia de Covid-19, AlCoB 2020 y AlCoB 2021 se fusionaron y celebrados juntos en estas fechas. Las actas de AlCoB 2020 se publicaron como LNBI 12099. Los 12 artículos completos incluidos en este volumen fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 22 presentaciones. Estaban organizados en secciones temáticas sobre genómica, filogenética y RNA-Seq y otros procesos biológicos. El alcance de AlCoB incluye temas de interés teórico o aplicado, a saber: análisis de secuencia; alineación de secuencias; montaje de secuencia; reordenamiento del genoma; hallazgo de motivos regulatorios; reconstrucción de filogenia; comparación de filogenia; predicción de estructuras; genómica compresiva; proteómica: vías moleculares, redes de interacción, análisis de espectrometría de masas; transcriptómica: variantes de empalme, inferencia y cuantificación de isoformas, análisis diferencial; secuenciación de próxima generación: genómica de poblaciones, metagenómica, metatranscriptómica, epigenómica; arquitectura del genoma CD; análisis de microbioma; biología computacional del cáncer; y biología de sistemas. Nota de contenido: Learning Molecular Classes from Small Numbers of Positive Examples Using Graph Grammars -- Can We Replace Reads by Numeric Signatures? Lyndon Fingerprints as Representations of Sequencing Reads for Machine Learning -- Exploiting Variable Sparsity in Computing Equilibria of Biological Dynamical Systems by Triangular Decomposition -- A Recovery Algorithm and Pooling Designs for One-Stage Noisy Group Testing Under the Probabilistic Framework -- Novel Phylogenetic Network Distances Based on Cherry Picking -- Best Match Graphs with Binary Trees -- Scalable and Accurate Phylogenetic Placement Using pplacer-XR -- Comparing Methods for Species Tree Estimation with Gene Duplication and Loss -- Reversal Distance on Genomes with Different Gene Content and Intergenic Regions Information -- Reversals Distance Considering Flexible Intergenic Regions Sizes -- Improved DNA-versus-Protein Homology Search for Protein Fossils -- The Maximum Weight Trace Alignment Merging Problem. Tipo de medio : Computadora Summary : This book constitutes the proceedings of the 8th International Conference on Algorithms for Computational Biology, AlCoB 2020, was planned to be held in Missoula, MT, USA in June 2021. Due to the Covid-19 pandemic, AlCoB 2020 and AlCoB 2021 were merged and held on these dates together. AlCoB 2020 proceedings were published as LNBI 12099. The 12 full papers included in this volume were carefully reviewed and selected from 22 submissions. They were organized in topical sections on genomics, phylogenetics, and RNA-Seq and other biological processes. The scope of AlCoB includes topics of either theoretical or applied interest, namely: sequence analysis; sequence alignment; sequence assembly; genome rearrangement; regulatory motif finding; phylogeny reconstruction; phylogeny comparison; structure prediction; compressive genomics; proteomics: molecular pathways, interaction networks, mass spectrometry analysis; transcriptomics: splicing variants, isoform inference and quantification, differential analysis; next-generation sequencing: population genomics, metagenomics, metatranscriptomics, epigenomics; genome CD architecture; microbiome analysis; cancer computational biology; and systems biology. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]

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