A Network-Based Approach to Cell Metabolism / Güell, Oriol  

Público ISBD Ningún comentario para este registro. Título : A Network-Based Approach to Cell Metabolism : From Structure to Flux Balances Tipo de documento: documento electrónico Autores: Güell, Oriol, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2017 Número de páginas: XX, 151 p. 49 ilustraciones ISBN/ISSN/DL: 978-3-319-64000-6 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Biotecnología  Bioinformática  Química Física  Bioingeniería Química  Biología Computacional y de Sistemas Clasificación: 660.63 Resumen: Esta tesis utiliza un enfoque a nivel de sistemas para estudiar el metabolismo celular, revelando nuevos mecanismos y respuestas que eran imposibles de alcanzar con los procedimientos reduccionistas tradicionales. Los resultados aquí presentados tienen una aplicación potencial en áreas como la ingeniería metabólica y el tratamiento de enfermedades. También podrían usarse para determinar la precisión de la esencialidad genética de nuevas reconstrucciones a escala del genoma. En este trabajo se han aplicado diferentes métodos y técnicas, dentro de los contextos de la Biología de Sistemas y el campo conocido como Análisis de Redes Complejas, para mostrar diferentes características de la robustez de las redes metabólicas. Las cuestiones específicas que se abordan aquí van desde aspectos topológicos puros de las propias redes hasta el equilibrio de los flujos bioquímicos. . Nota de contenido: Cellular Metabolism at the Systems Level -- Methods and Data -- Structural Knockout Cascades in Metabolic Networks -- Effects of Reaction Knockouts on Steady States of Metabolism -- Detection of Evolution and Adaptation Fingerprints in Metabolic Networks -- Assessing FBA Optimal States in the Feasible Flux Phenotypic Space -- Conclusions. Tipo de medio : Computadora Summary : This thesis uses a systems-level approach to study the cellular metabolism, unveiling new mechanisms and responses that were impossible to reach with traditional reductionists procedures. The results reported here have a potential application in areas like metabolic engineering and disease treatment. They could also be used in determining the accuracy of the gene essentiality of new genome-scale reconstructions. Different methods and techniques, within the contexts of Systems Biology and the field known as Complex Networks Analysis have been applied in this work to show different features of the robustness of metabolic networks. The specific issues addressed here range from pure topological aspec ts of the networks themselves to the balance of biochemical fluxes.    . Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] A Network-Based Approach to Cell Metabolism : From Structure to Flux Balances [documento electrónico] / Güell, Oriol,  . -  1 ed.  . - [s.l.] : Springer, 2017 . - XX, 151 p. 49 ilustraciones. ISBN : 978-3-319-64000-6 Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Biotecnología  Bioinformática  Química Física  Bioingeniería Química  Biología Computacional y de Sistemas Clasificación: 660.63 Resumen: Esta tesis utiliza un enfoque a nivel de sistemas para estudiar el metabolismo celular, revelando nuevos mecanismos y respuestas que eran imposibles de alcanzar con los procedimientos reduccionistas tradicionales. Los resultados aquí presentados tienen una aplicación potencial en áreas como la ingeniería metabólica y el tratamiento de enfermedades. También podrían usarse para determinar la precisión de la esencialidad genética de nuevas reconstrucciones a escala del genoma. En este trabajo se han aplicado diferentes métodos y técnicas, dentro de los contextos de la Biología de Sistemas y el campo conocido como Análisis de Redes Complejas, para mostrar diferentes características de la robustez de las redes metabólicas. Las cuestiones específicas que se abordan aquí van desde aspectos topológicos puros de las propias redes hasta el equilibrio de los flujos bioquímicos. . Nota de contenido: Cellular Metabolism at the Systems Level -- Methods and Data -- Structural Knockout Cascades in Metabolic Networks -- Effects of Reaction Knockouts on Steady States of Metabolism -- Detection of Evolution and Adaptation Fingerprints in Metabolic Networks -- Assessing FBA Optimal States in the Feasible Flux Phenotypic Space -- Conclusions. Tipo de medio : Computadora Summary : This thesis uses a systems-level approach to study the cellular metabolism, unveiling new mechanisms and responses that were impossible to reach with traditional reductionists procedures. The results reported here have a potential application in areas like metabolic engineering and disease treatment. They could also be used in determining the accuracy of the gene essentiality of new genome-scale reconstructions. Different methods and techniques, within the contexts of Systems Biology and the field known as Complex Networks Analysis have been applied in this work to show different features of the robustness of metabolic networks. The specific issues addressed here range from pure topological aspec ts of the networks themselves to the balance of biochemical fluxes.    . Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]

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