Autor Mandoiu, Ion.
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TÃtulo : 16th International Symposium, ISBRA 2020, Moscow, Russia, December 1–4, 2020, Proceedings Tipo de documento: documento electrónico Autores: Cai, Zhipeng, ; Mandoiu, Ion., ; Narasimhan, Giri, ; Skums, Pavel, ; Guo, Xuan, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2020 Número de páginas: XIV, 418 p. 143 ilustraciones, 110 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-57821-3 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Palabras clave: Bioinformática IngenierÃa Informática Red de computadoras Inteligencia artificial IngenierÃa Informática y Redes BiologÃa Computacional y de Sistemas Ãndice Dewey: 570.285 Resumen: Este libro constituye las actas del 16.º Simposio Internacional sobre Investigación y Aplicaciones de Bioinformática, ISBRA 2020, celebrado en Moscú, Rusia, en diciembre de 2020. Los 23 artÃculos completos y 18 artÃculos breves presentados en este libro fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 131 presentaciones. Se organizaron en secciones temáticas denominadas: análisis del genoma; Biologia de sistemas; proteómica computacional; aprendizaje automático y profundo; y análisis y metodologÃa de datos. Nota de contenido: Mitochondrial Haplogroup Assignment for High-Throughput Sequencing Data from Single Individual and Mixed DNA Samples -- Signet Ring Cell Detection with Classi cation Reinforcement Detection Network -- SPOC: Identification of Drug Targets in Biological Networks via Set Preference Output Control -- Identification of a novel compound heterozygous variant in NBAS causing bone fragility by the type of osteogenesis imperfecta -- Isoform-disease association prediction by data fusion -- EpIntMC: Detecting Epistatic Interactions using Multiple Clusterings -- Improving Metagenomic Classi cation using discriminative k-mers from sequencing data -- Dilated-DenseNet For Macromolecule Classifi cation In Cryo-electron Tomography -- Ess-NEXG: Predict Essential Proteins by Constructing a Weighted -- Protein Interaction Network based on Node Embedding and XGBoost -- mapAlign: an efficient approach for mapping and aligning long reads to reference genomes -- Functional Evolutionary Modeling Exposes Overlooked Protein-Coding Genes Involved in Cancer -- Testing the Agreement of Trees with Internal Labels -- SVLR: Genome Structure Variant Detection Using Long Read Sequencing Data -- De novo prediction of drug-target interaction via Laplacian regularized Schatten-p norm minimization -- Diagnosis of ASD from rs-fMRIs based on brain dynamic networks -- miRNA-Disease Associations Prediction Based on Negative Sample Selection and Multi-layer Perceptron -- Checking Phylogenetic Decisiveness in Theory and in Practice -- TNet: Phylogeny-Based Inference of Disease Transmission Networks Using Within-Host Strain Diversity -- Cancer breakpoint hotspots versus individual breakpoints prediction by machine learning models -- Integer Linear Programming Formulation for the Uni ed DuplicationLoss-Coalescence Model -- In silico-guided discovery of potential HIV-1 entry inhibitors mimicking bNAb N6: virtual screening, docking, molecular dynamics, and post-molecular modeling analysis -- Learning Structural Genetic Information via Graph Neural Embedding -- A New Network-based Tool to Analyse Competing Endogenous RNAs -- Deep Ensemble models for 16S Ribosomal Gene Classification -- Search for tandem repeats in the rst chromosome from the rice genome -- Deep Learning approach with rotate-shift invariant input to predict protein homodimer structure -- Development of a Neural Network-Based Approach for Prediction of Potential HIV-1 Entry Inhibitors Using Deep Learning and Molecular Modeling Methods -- In Silico Design and Evaluation of Novel Triazole-Based Compounds as Promising Drug Candidates Against Breast Cancer -- Identification of essential genes with NemoPro le and various machine learning models -- NemoLib: Network Motif Libraries for network motif detection and analysis -- Estimating enzyme participation in metabolic pathways for microbial communities from RNA-seq data -- Identication of Virus-Receptor Interactions based on Network Enhancement and Similarity -- Enhanced functional pathway annotations for differentiallyexpressed gene clusters -- Automated Detection of Sleep Apnea from Abdominal Respiratory Signal using Hilbert-Huang Transform -- Na/K-ATPase glutathionylation: in silico modeling of reaction mechanisms -- HiChew: a tool for TAD clustering in embryogenesis -- Generation of Hi-C maps from DNA sequence data using Deep Learning -- SC1: A Tool for Interactive Web-Based Single Cell RNA-Seq Data Analysis -- Quantitative analysis of the dynamics of maternal gradients in the early Drosophila embryo -- Atom Tracking Using Cayley Graphs -- SPOC: Identification of Drug Targets in Biological Networks via Set Preference Output Control -- Identification of a novel compound heterozygous variant in NBAS causing bone fragility by the type of osteogenesis imperfecta. . En lÃnea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i 16th International Symposium, ISBRA 2020, Moscow, Russia, December 1–4, 2020, Proceedings [documento electrónico] / Cai, Zhipeng, ; Mandoiu, Ion., ; Narasimhan, Giri, ; Skums, Pavel, ; Guo, Xuan, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2020 . - XIV, 418 p. 143 ilustraciones, 110 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-030-57821-3
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Palabras clave: Bioinformática IngenierÃa Informática Red de computadoras Inteligencia artificial IngenierÃa Informática y Redes BiologÃa Computacional y de Sistemas Ãndice Dewey: 570.285 Resumen: Este libro constituye las actas del 16.º Simposio Internacional sobre Investigación y Aplicaciones de Bioinformática, ISBRA 2020, celebrado en Moscú, Rusia, en diciembre de 2020. Los 23 artÃculos completos y 18 artÃculos breves presentados en este libro fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 131 presentaciones. Se organizaron en secciones temáticas denominadas: análisis del genoma; Biologia de sistemas; proteómica computacional; aprendizaje automático y profundo; y análisis y metodologÃa de datos. Nota de contenido: Mitochondrial Haplogroup Assignment for High-Throughput Sequencing Data from Single Individual and Mixed DNA Samples -- Signet Ring Cell Detection with Classi cation Reinforcement Detection Network -- SPOC: Identification of Drug Targets in Biological Networks via Set Preference Output Control -- Identification of a novel compound heterozygous variant in NBAS causing bone fragility by the type of osteogenesis imperfecta -- Isoform-disease association prediction by data fusion -- EpIntMC: Detecting Epistatic Interactions using Multiple Clusterings -- Improving Metagenomic Classi cation using discriminative k-mers from sequencing data -- Dilated-DenseNet For Macromolecule Classifi cation In Cryo-electron Tomography -- Ess-NEXG: Predict Essential Proteins by Constructing a Weighted -- Protein Interaction Network based on Node Embedding and XGBoost -- mapAlign: an efficient approach for mapping and aligning long reads to reference genomes -- Functional Evolutionary Modeling Exposes Overlooked Protein-Coding Genes Involved in Cancer -- Testing the Agreement of Trees with Internal Labels -- SVLR: Genome Structure Variant Detection Using Long Read Sequencing Data -- De novo prediction of drug-target interaction via Laplacian regularized Schatten-p norm minimization -- Diagnosis of ASD from rs-fMRIs based on brain dynamic networks -- miRNA-Disease Associations Prediction Based on Negative Sample Selection and Multi-layer Perceptron -- Checking Phylogenetic Decisiveness in Theory and in Practice -- TNet: Phylogeny-Based Inference of Disease Transmission Networks Using Within-Host Strain Diversity -- Cancer breakpoint hotspots versus individual breakpoints prediction by machine learning models -- Integer Linear Programming Formulation for the Uni ed DuplicationLoss-Coalescence Model -- In silico-guided discovery of potential HIV-1 entry inhibitors mimicking bNAb N6: virtual screening, docking, molecular dynamics, and post-molecular modeling analysis -- Learning Structural Genetic Information via Graph Neural Embedding -- A New Network-based Tool to Analyse Competing Endogenous RNAs -- Deep Ensemble models for 16S Ribosomal Gene Classification -- Search for tandem repeats in the rst chromosome from the rice genome -- Deep Learning approach with rotate-shift invariant input to predict protein homodimer structure -- Development of a Neural Network-Based Approach for Prediction of Potential HIV-1 Entry Inhibitors Using Deep Learning and Molecular Modeling Methods -- In Silico Design and Evaluation of Novel Triazole-Based Compounds as Promising Drug Candidates Against Breast Cancer -- Identification of essential genes with NemoPro le and various machine learning models -- NemoLib: Network Motif Libraries for network motif detection and analysis -- Estimating enzyme participation in metabolic pathways for microbial communities from RNA-seq data -- Identication of Virus-Receptor Interactions based on Network Enhancement and Similarity -- Enhanced functional pathway annotations for differentiallyexpressed gene clusters -- Automated Detection of Sleep Apnea from Abdominal Respiratory Signal using Hilbert-Huang Transform -- Na/K-ATPase glutathionylation: in silico modeling of reaction mechanisms -- HiChew: a tool for TAD clustering in embryogenesis -- Generation of Hi-C maps from DNA sequence data using Deep Learning -- SC1: A Tool for Interactive Web-Based Single Cell RNA-Seq Data Analysis -- Quantitative analysis of the dynamics of maternal gradients in the early Drosophila embryo -- Atom Tracking Using Cayley Graphs -- SPOC: Identification of Drug Targets in Biological Networks via Set Preference Output Control -- Identification of a novel compound heterozygous variant in NBAS causing bone fragility by the type of osteogenesis imperfecta. . En lÃnea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i
TÃtulo : 9th International Conference, ICCABS 2019, Miami, FL, USA, November 15–17, 2019, Revised Selected Papers Tipo de documento: documento electrónico Autores: Mandoiu, Ion., ; Murali, T. M., ; Narasimhan, Giri, ; Rajasekaran, Sanguthevar, ; Skums, Pavel, ; Zelikovsky, Alexander, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2020 Número de páginas: XII, 199 p. 70 ilustraciones, 55 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-46165-2 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Palabras clave: Software de la aplicacion Red de computadoras Aprendizaje automático IngenierÃa de software Visión por computador Aplicaciones informáticas y de sistemas de información Redes de comunicación informática Ãndice Dewey: 005.3 Ciencia de los computadores (Programas) Resumen: Este libro constituye artÃculos seleccionados revisados ​​de la 9.ª Conferencia Internacional sobre Avances Computacionales en Ciencias Bio y Médicas, ICCABS 2019, celebrada en Miami, Florida, EE. UU. en noviembre de 2019. Los 15 artÃculos presentados en este volumen fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 30 presentaciones. Tratan temas como biologÃa computacional; análisis de imágenes biomédicas; redes biológicas; genómica del cáncer; análisis de enriquecimiento genético; genómica funcional; redes de interacción; predicción de la estructura de proteÃnas; programación dinámica; y análisis de microbioma. Nota de contenido: Detecting de novo Plasmodesmata targeting signals and identifying PD targeting proteins -- The Agility of a Neuron: Phase Shift between Sinusoidal Current Input and Firing Rate Curve -- Efficient Sequential and Parallel Algorithms for Incremental Record Linkage -- Autoencoder Based Methods for Diagnosis of Autism Spectrum Disorder -- FastFeatGen: Faster parallel feature extraction from genome sequences and efficient prediction of DNA $Nˆ6$-methyladenine sites -- Optimized multiple fluorescence based detection in a single molecule synthesis process under high noise level environment -- Deep learning of CTCF-mediated chromatin loops in 3D genome organization -- Effects of Various Alpha-1 Antitrypsin Supplement Dosages on the Lung Microbiome and Metabolome -- A Multi-Hypothesis Learning Algorithm for Human and Mouse miRNA Target Prediction -- RiboSimR: a tool for simulation and power analysis of Ribo-seq experiments -- Treatment Practice Analysis of Intermediate or High Risk Localized Prostate Cancer: A Multi-Center Study with Veterans Health Administration Data -- Parametric Prediction Model for Annual Growth of Electron Microscopy Data -- locStra: Fast analysis of local/global stratification in whole genome sequencing (WGS) studies -- A new graph database system for multi-omics data integration and mining complex biological information -- SMART2: Multi-Library Statistical Mitogenome Assembly with Repeats. En lÃnea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i 9th International Conference, ICCABS 2019, Miami, FL, USA, November 15–17, 2019, Revised Selected Papers [documento electrónico] / Mandoiu, Ion., ; Murali, T. M., ; Narasimhan, Giri, ; Rajasekaran, Sanguthevar, ; Skums, Pavel, ; Zelikovsky, Alexander, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2020 . - XII, 199 p. 70 ilustraciones, 55 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-030-46165-2
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Palabras clave: Software de la aplicacion Red de computadoras Aprendizaje automático IngenierÃa de software Visión por computador Aplicaciones informáticas y de sistemas de información Redes de comunicación informática Ãndice Dewey: 005.3 Ciencia de los computadores (Programas) Resumen: Este libro constituye artÃculos seleccionados revisados ​​de la 9.ª Conferencia Internacional sobre Avances Computacionales en Ciencias Bio y Médicas, ICCABS 2019, celebrada en Miami, Florida, EE. UU. en noviembre de 2019. Los 15 artÃculos presentados en este volumen fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 30 presentaciones. Tratan temas como biologÃa computacional; análisis de imágenes biomédicas; redes biológicas; genómica del cáncer; análisis de enriquecimiento genético; genómica funcional; redes de interacción; predicción de la estructura de proteÃnas; programación dinámica; y análisis de microbioma. Nota de contenido: Detecting de novo Plasmodesmata targeting signals and identifying PD targeting proteins -- The Agility of a Neuron: Phase Shift between Sinusoidal Current Input and Firing Rate Curve -- Efficient Sequential and Parallel Algorithms for Incremental Record Linkage -- Autoencoder Based Methods for Diagnosis of Autism Spectrum Disorder -- FastFeatGen: Faster parallel feature extraction from genome sequences and efficient prediction of DNA $Nˆ6$-methyladenine sites -- Optimized multiple fluorescence based detection in a single molecule synthesis process under high noise level environment -- Deep learning of CTCF-mediated chromatin loops in 3D genome organization -- Effects of Various Alpha-1 Antitrypsin Supplement Dosages on the Lung Microbiome and Metabolome -- A Multi-Hypothesis Learning Algorithm for Human and Mouse miRNA Target Prediction -- RiboSimR: a tool for simulation and power analysis of Ribo-seq experiments -- Treatment Practice Analysis of Intermediate or High Risk Localized Prostate Cancer: A Multi-Center Study with Veterans Health Administration Data -- Parametric Prediction Model for Annual Growth of Electron Microscopy Data -- locStra: Fast analysis of local/global stratification in whole genome sequencing (WGS) studies -- A new graph database system for multi-omics data integration and mining complex biological information -- SMART2: Multi-Library Statistical Mitogenome Assembly with Repeats. En lÃnea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i
TÃtulo : Computational Advances in Bio and Medical Sciences : 10th International Conference, ICCABS 2020, Virtual Event, December 10-12, 2020, Revised Selected Papers Tipo de documento: documento electrónico Autores: Jha, Sumit Kumar, ; Mandoiu, Ion., ; Rajasekaran, Sanguthevar, ; Skums, Pavel, ; Zelikovsky, Alex, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2021 Número de páginas: X, 143 p. 36 ilustraciones, 30 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-79290-9 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Palabras clave: Software de la aplicacion Computadoras Propósitos especiales Ciencias sociales Red de computadoras Aplicaciones informáticas y de sistemas de información Sistemas de propósito especial y basados ​​en aplicaciones Aplicación informática en ciencias sociales y del comportamiento Redes de comunicación informática Ãndice Dewey: 005.3 Ciencia de los computadores (Programas) Resumen: Este libro constituye las actas de la Décima Conferencia Internacional sobre Avances Computacionales en Ciencias Bio y Médicas, ICCABS 2020, celebrada en diciembre de 2020. Debido a la pandemia de COVID-19, la conferencia se llevó a cabo de forma virtual. Los 6 artÃculos regulares y 5 invitados presentados en este libro fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 16 presentaciones. El uso de tecnologÃas de alto rendimiento está cambiando fundamentalmente las ciencias biológicas y dando lugar a la recopilación de grandes cantidades de datos biológicos y médicos. Los artÃculos muestran cómo el uso de estos datos puede ayudar a ampliar nuestro conocimiento de los procesos biológicos fundamentales y mejorar la salud humana, utilizando nuevos modelos computacionales y algoritmos de análisis avanzados. En lÃnea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i Computational Advances in Bio and Medical Sciences : 10th International Conference, ICCABS 2020, Virtual Event, December 10-12, 2020, Revised Selected Papers [documento electrónico] / Jha, Sumit Kumar, ; Mandoiu, Ion., ; Rajasekaran, Sanguthevar, ; Skums, Pavel, ; Zelikovsky, Alex, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2021 . - X, 143 p. 36 ilustraciones, 30 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-030-79290-9
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Palabras clave: Software de la aplicacion Computadoras Propósitos especiales Ciencias sociales Red de computadoras Aplicaciones informáticas y de sistemas de información Sistemas de propósito especial y basados ​​en aplicaciones Aplicación informática en ciencias sociales y del comportamiento Redes de comunicación informática Ãndice Dewey: 005.3 Ciencia de los computadores (Programas) Resumen: Este libro constituye las actas de la Décima Conferencia Internacional sobre Avances Computacionales en Ciencias Bio y Médicas, ICCABS 2020, celebrada en diciembre de 2020. Debido a la pandemia de COVID-19, la conferencia se llevó a cabo de forma virtual. Los 6 artÃculos regulares y 5 invitados presentados en este libro fueron cuidadosamente revisados ​​y seleccionados entre 16 presentaciones. El uso de tecnologÃas de alto rendimiento está cambiando fundamentalmente las ciencias biológicas y dando lugar a la recopilación de grandes cantidades de datos biológicos y médicos. Los artÃculos muestran cómo el uso de estos datos puede ayudar a ampliar nuestro conocimiento de los procesos biológicos fundamentales y mejorar la salud humana, utilizando nuevos modelos computacionales y algoritmos de análisis avanzados. En lÃnea: https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Link: https://biblioteca.umanizales.edu.co/ils/opac_css/index.php?lvl=notice_display&i
