TÃtulo : |
Polarizable Embedding for the Algebraic-Diagrammatic Construction Scheme : Investigating Photoexcitations in Large Biomolecular Systems |
Tipo de documento: |
documento electrónico |
Autores: |
Scheurer, Maximilian, |
Mención de edición: |
1 ed. |
Editorial: |
Berlin [Alemania] : Springer |
Fecha de publicación: |
2020 |
Número de páginas: |
X, 97 p. 12 ilustraciones |
ISBN/ISSN/DL: |
978-3-658-31281-7 |
Nota general: |
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. |
Idioma : |
Inglés (eng) |
Palabras clave: |
QuÃmica FÃsica y Teórica. QuÃmica Inorgánica QuÃmica FÃsica QuÃmica Computacional QuÃmica Teórica |
Clasificación: |
542.85 |
Resumen: |
Maximilian Scheurer presenta un método para modelar estados excitados en entornos atomÃsticos y heterogéneos. El método utiliza el modelo de incrustación polarizable (PE) para imitar las interacciones electrostáticas y de polarización de una molécula con su entorno. Para el modelado de alto nivel de los estados excitados de la molécula, se emplea el esquema de construcción diagrama algebraico para el propagador de polarización (ADC). El trabajo presentado describe los fundamentos teóricos de PE y ADC y la combinación de ambos métodos, denominada PE-ADC. Se prueba la precisión de PE-ADC y se estudia la excitación de transferencia de carga (CT) en la proteÃna dodecina. Este libro presenta una elaboración exhaustiva del nuevo método PE-ADC y una aplicación de última generación de PE-ADC a un proceso fotobioquÃmico. Contenido Introducción completa a los modelos de incrustación polarizables Derivación del enfoque PE-ADC perturbativo y estudio de caso de referencia de un mecanismo de extinción de flavoproteÃnas Grupos objetivo Profesores y estudiantes de fotoquÃmica computacional QuÃmicos computacionales en el campo del modelado de solventes El autor Maximilian Scheurer estudió BioquÃmica y ahora es Estudiante de doctorado en el grupo de QuÃmica Teórica y Computacional del Prof. Dr. Andreas Dreuw en el Interdisciplinario de Computación CientÃfica de la Universidad de Heidelberg, Alemania. Su principal foco de investigación es el desarrollo de métodos ab-initio para estados excitados, propiedades moleculares y la aplicación de dichos métodos a procesos fotoquÃmicos en sistemas biomoleculares. |
Nota de contenido: |
Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models -- Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark -- Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism. |
Tipo de medio : |
Computadora |
Summary : |
Maximilian Scheurer presents a method for modeling excited states in atomistic, heterogeneous environments. The method utilizes the polarizable embedding (PE) model to mimic electrostatic and polarization interactions of a molecule with its environment. For high-level modeling of the molecule's excited states, the algebraic-diagrammatic construction scheme for the polarization propagator (ADC) is employed. The presented work outlines the theoretical foundations of PE and ADC and the combination of both methods, termed PE-ADC. The accuracy of PE-ADC is tested, and the charge-transfer (CT) excitation in the dodecin protein is studied. This book presents a comprehensive elaboration on the new PE-ADC method and a state-of-the-art application of PE-ADC to a photo-biochemical process. Contents Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism Target Groups Lecturers and students in computational photochemistry Computational chemists in the field of solvent modeling The Author Maximilian Scheurer studied Biochemistry and is now a PhD student in the Theoretical and Computational Chemistry group of Prof. Dr. Andreas Dreuw at the Interdisciplinary for Scientific Computing at Heidelberg University, Germany. His main research focus is the development of ab-initio methods for excited states, molecular properties, and application of such methods to photochemical processes in biomolecular systems. |
Enlace de acceso : |
https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] |
Polarizable Embedding for the Algebraic-Diagrammatic Construction Scheme : Investigating Photoexcitations in Large Biomolecular Systems [documento electrónico] / Scheurer, Maximilian, . - 1 ed. . - Berlin [Alemania] : Springer, 2020 . - X, 97 p. 12 ilustraciones. ISBN : 978-3-658-31281-7 Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés ( eng)
Palabras clave: |
QuÃmica FÃsica y Teórica. QuÃmica Inorgánica QuÃmica FÃsica QuÃmica Computacional QuÃmica Teórica |
Clasificación: |
542.85 |
Resumen: |
Maximilian Scheurer presenta un método para modelar estados excitados en entornos atomÃsticos y heterogéneos. El método utiliza el modelo de incrustación polarizable (PE) para imitar las interacciones electrostáticas y de polarización de una molécula con su entorno. Para el modelado de alto nivel de los estados excitados de la molécula, se emplea el esquema de construcción diagrama algebraico para el propagador de polarización (ADC). El trabajo presentado describe los fundamentos teóricos de PE y ADC y la combinación de ambos métodos, denominada PE-ADC. Se prueba la precisión de PE-ADC y se estudia la excitación de transferencia de carga (CT) en la proteÃna dodecina. Este libro presenta una elaboración exhaustiva del nuevo método PE-ADC y una aplicación de última generación de PE-ADC a un proceso fotobioquÃmico. Contenido Introducción completa a los modelos de incrustación polarizables Derivación del enfoque PE-ADC perturbativo y estudio de caso de referencia de un mecanismo de extinción de flavoproteÃnas Grupos objetivo Profesores y estudiantes de fotoquÃmica computacional QuÃmicos computacionales en el campo del modelado de solventes El autor Maximilian Scheurer estudió BioquÃmica y ahora es Estudiante de doctorado en el grupo de QuÃmica Teórica y Computacional del Prof. Dr. Andreas Dreuw en el Interdisciplinario de Computación CientÃfica de la Universidad de Heidelberg, Alemania. Su principal foco de investigación es el desarrollo de métodos ab-initio para estados excitados, propiedades moleculares y la aplicación de dichos métodos a procesos fotoquÃmicos en sistemas biomoleculares. |
Nota de contenido: |
Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models -- Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark -- Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism. |
Tipo de medio : |
Computadora |
Summary : |
Maximilian Scheurer presents a method for modeling excited states in atomistic, heterogeneous environments. The method utilizes the polarizable embedding (PE) model to mimic electrostatic and polarization interactions of a molecule with its environment. For high-level modeling of the molecule's excited states, the algebraic-diagrammatic construction scheme for the polarization propagator (ADC) is employed. The presented work outlines the theoretical foundations of PE and ADC and the combination of both methods, termed PE-ADC. The accuracy of PE-ADC is tested, and the charge-transfer (CT) excitation in the dodecin protein is studied. This book presents a comprehensive elaboration on the new PE-ADC method and a state-of-the-art application of PE-ADC to a photo-biochemical process. Contents Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism Target Groups Lecturers and students in computational photochemistry Computational chemists in the field of solvent modeling The Author Maximilian Scheurer studied Biochemistry and is now a PhD student in the Theoretical and Computational Chemistry group of Prof. Dr. Andreas Dreuw at the Interdisciplinary for Scientific Computing at Heidelberg University, Germany. His main research focus is the development of ab-initio methods for excited states, molecular properties, and application of such methods to photochemical processes in biomolecular systems. |
Enlace de acceso : |
https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] |
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