Engineering a Robust DNA Circuit for the Direct Detection of Biomolecular Interactions / Yan Shan, Ang  

Público ISBD Ningún comentario para este registro. Título : Engineering a Robust DNA Circuit for the Direct Detection of Biomolecular Interactions Tipo de documento: documento electrónico Autores: Yan Shan, Ang, Mención de edición: 1 ed. Editorial: Singapore [Malasia] : Springer Fecha de publicación: 2018 Número de páginas: XLV, 188 p. 117 ilustraciones, 30 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-981-1321887-- Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Biotecnología  Bioinformática  Microtecnología  Sistemas micro electromecánicos  Bioingeniería Química  Biología Computacional y de Sistemas  Microsistemas y MEMS Clasificación: 660.63 Resumen: Este libro proporciona información esencial sobre el diseño de un circuito de ADN localizado para promover la velocidad de las reacciones de hibridación deseadas sobre las reacciones de fuga no deseadas en la solución a granel. El área de la nanotecnología dinámica del ADN, o circuitos de ADN, es muy prometedora como caja de herramientas altamente programable que puede usarse en diversas aplicaciones, incluida la computación molecular y la detección biomolecular. Sin embargo, un obstáculo clave es el problema recurrente de las fugas en los circuitos. El ensamblaje del circuito localizado está impulsado dinámicamente por el reconocimiento de biomoléculas, un enfoque diferente al de la mayoría de los métodos, que se basan en un ensamblaje estático de origami de ADN. Las pautas de diseño para los módulos de reacción individuales que se presentan aquí, que se centran en minimizar las fugas del circuito, se establecen mediante la simulación NUPACK y se prueban experimentalmente, lo que será útil para los investigadores interesados ​​en adaptar los conceptos a otros contextos. En la sección final, los conceptos de diseño se aplican con éxito a la detección biomolecular de una amplia gama de objetivos, incluidas mutaciones de un solo nucleótido, proteínas y receptores de superficie celular. . Nota de contenido: Introduction -- Literature Review -- Materials and Methods -- Modular Framework for Engineering a Self-Contained DNA Circuit -- Designing Hybridization Chain Reaction Monomers for Robust Signal Amplification -- Design Concepts in Association Toehold for Robust Signal Transduction -- DNA Split Proximity Circuit as a General Platform for Interrogating Biomolecular Events -- DNA Split Proximity Circuit for Visualizing Cell Surface Receptor Clustering- A Case Study Using Human Epidermal Growth Factor Receptor Family -- Conclusion and Future Outlooks. Tipo de medio : Computadora Summary : This book provides essential insights into designing a localized DNA circuit to promote the rate of desired hybridization reactions over undesired leak reactions in the bulk solution. The area of dynamic DNA nanotechnology, or DNA circuits, holds great promise as a highly programmable toolbox that can be used in various applications, including molecular computing and biomolecular detection. However, a key bottleneck is the recurring issue of circuit leakage. The assembly of the localized circuit is dynamically driven by the recognition of biomolecules – a different approach from most methods, which are based on a static DNA origami assembly. The design guidelines for individual reaction modules presented here, which focus on minimizing circuit leakage, are established through NUPACK simulation and tested experimentally – which will be useful for researchers interested in adapting the concepts for other contexts. In the closing section, the design concepts are successfully applied to the biomolecular sensing of a broad range of targets including the single nucleotide mutations, proteins, and cell surface receptors. . Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Engineering a Robust DNA Circuit for the Direct Detection of Biomolecular Interactions [documento electrónico] / Yan Shan, Ang,  . -  1 ed.  . - Singapore [Malasia] : Springer, 2018 . - XLV, 188 p. 117 ilustraciones, 30 ilustraciones en color. ISBN : 978-981-1321887-- Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Biotecnología  Bioinformática  Microtecnología  Sistemas micro electromecánicos  Bioingeniería Química  Biología Computacional y de Sistemas  Microsistemas y MEMS Clasificación: 660.63 Resumen: Este libro proporciona información esencial sobre el diseño de un circuito de ADN localizado para promover la velocidad de las reacciones de hibridación deseadas sobre las reacciones de fuga no deseadas en la solución a granel. El área de la nanotecnología dinámica del ADN, o circuitos de ADN, es muy prometedora como caja de herramientas altamente programable que puede usarse en diversas aplicaciones, incluida la computación molecular y la detección biomolecular. Sin embargo, un obstáculo clave es el problema recurrente de las fugas en los circuitos. El ensamblaje del circuito localizado está impulsado dinámicamente por el reconocimiento de biomoléculas, un enfoque diferente al de la mayoría de los métodos, que se basan en un ensamblaje estático de origami de ADN. Las pautas de diseño para los módulos de reacción individuales que se presentan aquí, que se centran en minimizar las fugas del circuito, se establecen mediante la simulación NUPACK y se prueban experimentalmente, lo que será útil para los investigadores interesados ​​en adaptar los conceptos a otros contextos. En la sección final, los conceptos de diseño se aplican con éxito a la detección biomolecular de una amplia gama de objetivos, incluidas mutaciones de un solo nucleótido, proteínas y receptores de superficie celular. . Nota de contenido: Introduction -- Literature Review -- Materials and Methods -- Modular Framework for Engineering a Self-Contained DNA Circuit -- Designing Hybridization Chain Reaction Monomers for Robust Signal Amplification -- Design Concepts in Association Toehold for Robust Signal Transduction -- DNA Split Proximity Circuit as a General Platform for Interrogating Biomolecular Events -- DNA Split Proximity Circuit for Visualizing Cell Surface Receptor Clustering- A Case Study Using Human Epidermal Growth Factor Receptor Family -- Conclusion and Future Outlooks. Tipo de medio : Computadora Summary : This book provides essential insights into designing a localized DNA circuit to promote the rate of desired hybridization reactions over undesired leak reactions in the bulk solution. The area of dynamic DNA nanotechnology, or DNA circuits, holds great promise as a highly programmable toolbox that can be used in various applications, including molecular computing and biomolecular detection. However, a key bottleneck is the recurring issue of circuit leakage. The assembly of the localized circuit is dynamically driven by the recognition of biomolecules – a different approach from most methods, which are based on a static DNA origami assembly. The design guidelines for individual reaction modules presented here, which focus on minimizing circuit leakage, are established through NUPACK simulation and tested experimentally – which will be useful for researchers interested in adapting the concepts for other contexts. In the closing section, the design concepts are successfully applied to the biomolecular sensing of a broad range of targets including the single nucleotide mutations, proteins, and cell surface receptors. . Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]

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