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TÃtulo : A Mathematical Approach to Protein Biophysics Tipo de documento: documento electrónico Autores: Scott, L. Ridgway, ; Fernández, Ariel, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2017 Número de páginas: XI, 290 p. 110 ilustraciones, 27 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-319-66032-5 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Biomatemáticas Bioinformática ProteÃnas BioquÃmica clÃnica BiologÃa Matemática y Computacional BiologÃa Computacional y de Sistemas BioquÃmica de proteÃnas BioquÃmica Médica Clasificación: 570.285 Resumen: Este libro explora aspectos cuantitativos de la biofÃsica de proteÃnas e intenta delinear ciertas reglas de comportamiento molecular que hacen que los objetos a escala atómica se comporten de manera digital. Este libro ayudará a los lectores a comprender cómo ciertos sistemas biológicos que involucran proteÃnas funcionan como sistemas de información digitales a pesar de que los procesos subyacentes son de naturaleza analógica. La explicación detallada de las proteÃnas desde un punto de vista cuantitativo y la variedad de niveles de ejercicios (incluidos experimentos fÃsicos) al final de cada capÃtulo atraerán a los estudiantes universitarios y de posgrado en matemáticas, informática, ingenierÃa mecánica y fÃsica. , con ganas de aprender sobre la biofÃsica de las proteÃnas. L. Ridgway Scott ha sido profesor de Ciencias de la Computación y Matemáticas en la Universidad de Chicago desde 1998, y profesor Louis Block desde 2001. Obtuvo una licenciatura (Magna Cum Laude) de la Universidad de Tulane en 1969 y un doctorado en Matemáticas de la Universidad de Tulane. Instituto de TecnologÃa de Massachusetts en 1973. El profesor Scott ha publicado más de 130 artÃculos y tres libros, que abarcan biofÃsica, computación paralela y aspectos informáticos fundamentales de la mecánica estructural, la dinámica de fluidos, la ingenierÃa nuclear y la quÃmica computacional. Ariel Fernández (nacido Ariel Fernández Stigliano) es un fÃsico quÃmico y matemático argentino-estadounidense. Obtuvo su doctorado en FÃsica QuÃmica de la Universidad de Yale y ocupó la Cátedra Karl F. Hasselmann en BioingenierÃa en la Universidad Rice. Actualmente participa en actividades de investigación y emprendimiento en diversas consultoras. Ariel Fernández es autor de tres libros sobre medicina traslacional y biofÃsica y publicó 360 artÃculos en revistas profesionales. Posee dos patentes en el campo de la biotecnologÃa. Nota de contenido: Understanding Proteins as Digital Widgets -- Digital Rules for Proteins -- Electrostatic Forces -- Protein Basics -- Protein Structure -- Hydrogen Bonds -- Composition of Protein-Protein Interfaces -- Wrapping Electrostatic Bonds -- Stickiness of Dehydrons -- Electrostatic Force Details -- Dehydrons in Protein Interactivity -- Aromatic Interactions -- Peptide Bond Rotation -- Continuum Equations for Electrostatics -- Wrapping Technology -- Epilogue -- Units -- Notes -- Glossary -- Index. . Tipo de medio : Computadora Summary : This book explores quantitative aspects of protein biophysics and attempts to delineate certain rules of molecular behavior that make atomic scale objects behave in a digital way. This book will help readers to understand how certain biological systems involving proteins function as digital information systems despite the fact that underlying processes are analog in nature. The in-depth explanation of proteins from a quantitative point of view and the variety of level of exercises (including physical experiments) at the end of each chapter will appeal to graduate and senior undergraduate students in mathematics, computer science, mechanical engineering, and physics, wanting to learn about the biophysics of proteins. L. Ridgway Scott has been Professor of Computer Science and of Mathematics at the University of Chicago since 1998, and the Louis Block Professor since 2001. He obtained a B.S. degree (Magna Cum Laude) from Tulane Universityin 1969 and a PhD degree in Mathematics from the Massachusetts Institute of Technology in 1973. Professor Scott has published over 130 papers and three books, extending over biophysics, parallel computing and fundamental computing aspects of structural mechanics, fluid dynamics, nuclear engineering, and computational chemistry. Ariel Fernández (born Ariel Fernández Stigliano) is an Argentinian-American physical chemist and mathematician. He obtained his Ph. D. degree in Chemical Physics from Yale University and held the Karl F. Hasselmann Endowed Chair Professorship in Bioengineering at Rice University. He is currently involved in research and entrepreneurial activities at various consultancy firms. Ariel Fernández authored three books on translational medicine and biophysics, and published 360 papers in professional journals. He holds two patents in the field of biotechnology. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] A Mathematical Approach to Protein Biophysics [documento electrónico] / Scott, L. Ridgway, ; Fernández, Ariel, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2017 . - XI, 290 p. 110 ilustraciones, 27 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-319-66032-5
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Biomatemáticas Bioinformática ProteÃnas BioquÃmica clÃnica BiologÃa Matemática y Computacional BiologÃa Computacional y de Sistemas BioquÃmica de proteÃnas BioquÃmica Médica Clasificación: 570.285 Resumen: Este libro explora aspectos cuantitativos de la biofÃsica de proteÃnas e intenta delinear ciertas reglas de comportamiento molecular que hacen que los objetos a escala atómica se comporten de manera digital. Este libro ayudará a los lectores a comprender cómo ciertos sistemas biológicos que involucran proteÃnas funcionan como sistemas de información digitales a pesar de que los procesos subyacentes son de naturaleza analógica. La explicación detallada de las proteÃnas desde un punto de vista cuantitativo y la variedad de niveles de ejercicios (incluidos experimentos fÃsicos) al final de cada capÃtulo atraerán a los estudiantes universitarios y de posgrado en matemáticas, informática, ingenierÃa mecánica y fÃsica. , con ganas de aprender sobre la biofÃsica de las proteÃnas. L. Ridgway Scott ha sido profesor de Ciencias de la Computación y Matemáticas en la Universidad de Chicago desde 1998, y profesor Louis Block desde 2001. Obtuvo una licenciatura (Magna Cum Laude) de la Universidad de Tulane en 1969 y un doctorado en Matemáticas de la Universidad de Tulane. Instituto de TecnologÃa de Massachusetts en 1973. El profesor Scott ha publicado más de 130 artÃculos y tres libros, que abarcan biofÃsica, computación paralela y aspectos informáticos fundamentales de la mecánica estructural, la dinámica de fluidos, la ingenierÃa nuclear y la quÃmica computacional. Ariel Fernández (nacido Ariel Fernández Stigliano) es un fÃsico quÃmico y matemático argentino-estadounidense. Obtuvo su doctorado en FÃsica QuÃmica de la Universidad de Yale y ocupó la Cátedra Karl F. Hasselmann en BioingenierÃa en la Universidad Rice. Actualmente participa en actividades de investigación y emprendimiento en diversas consultoras. Ariel Fernández es autor de tres libros sobre medicina traslacional y biofÃsica y publicó 360 artÃculos en revistas profesionales. Posee dos patentes en el campo de la biotecnologÃa. Nota de contenido: Understanding Proteins as Digital Widgets -- Digital Rules for Proteins -- Electrostatic Forces -- Protein Basics -- Protein Structure -- Hydrogen Bonds -- Composition of Protein-Protein Interfaces -- Wrapping Electrostatic Bonds -- Stickiness of Dehydrons -- Electrostatic Force Details -- Dehydrons in Protein Interactivity -- Aromatic Interactions -- Peptide Bond Rotation -- Continuum Equations for Electrostatics -- Wrapping Technology -- Epilogue -- Units -- Notes -- Glossary -- Index. . Tipo de medio : Computadora Summary : This book explores quantitative aspects of protein biophysics and attempts to delineate certain rules of molecular behavior that make atomic scale objects behave in a digital way. This book will help readers to understand how certain biological systems involving proteins function as digital information systems despite the fact that underlying processes are analog in nature. The in-depth explanation of proteins from a quantitative point of view and the variety of level of exercises (including physical experiments) at the end of each chapter will appeal to graduate and senior undergraduate students in mathematics, computer science, mechanical engineering, and physics, wanting to learn about the biophysics of proteins. L. Ridgway Scott has been Professor of Computer Science and of Mathematics at the University of Chicago since 1998, and the Louis Block Professor since 2001. He obtained a B.S. degree (Magna Cum Laude) from Tulane Universityin 1969 and a PhD degree in Mathematics from the Massachusetts Institute of Technology in 1973. Professor Scott has published over 130 papers and three books, extending over biophysics, parallel computing and fundamental computing aspects of structural mechanics, fluid dynamics, nuclear engineering, and computational chemistry. Ariel Fernández (born Ariel Fernández Stigliano) is an Argentinian-American physical chemist and mathematician. He obtained his Ph. D. degree in Chemical Physics from Yale University and held the Karl F. Hasselmann Endowed Chair Professorship in Bioengineering at Rice University. He is currently involved in research and entrepreneurial activities at various consultancy firms. Ariel Fernández authored three books on translational medicine and biophysics, and published 360 papers in professional journals. He holds two patents in the field of biotechnology. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
TÃtulo : A Practical Guide to Using Glycomics Databases Tipo de documento: documento electrónico Autores: Aoki-Kinoshita, Kiyoko F., Mención de edición: 1 ed. Editorial: Tokyo [Japón] : Springer Fecha de publicación: 2017 Número de páginas: IX, 370 p. 226 ilustraciones, 178 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-4-431-56454-6 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Bioinformática ProteÃnas BioquÃmica de proteÃnas Clasificación: 570.285 Resumen: Este libro proporciona a los glicocientÃficos un manual de bases de datos útiles que pueden aplicarse a la investigación de la glicociencia. Aunque muchas bases de datos ahora están disponibles públicamente, uno de los obstáculos para sus usuarios es la curva de aprendizaje necesaria para utilizarlas de manera efectiva. Por lo tanto, este libro no solo describe las bases de datos existentes, sino que también brinda consejos sobre cómo obtener los datos de destino. Es decir, debido a que muchas bases de datos proporcionan una variedad de datos que podrÃan obtenerse desde diferentes perspectivas, cada capÃtulo proporciona a los usuarios preguntas biológicas potenciales que pueden ser respondidas por una base de datos particular e instrucciones paso a paso, con figuras, sobre cómo obtenerlos. esos datos. También se proporcionan sugerencias para ayudar a los usuarios a encontrar problemas que pueden predecirse al utilizar estas bases de datos. Además, se proporciona información de contacto para cada base de datos en caso de que surjan problemas inesperados. Nota de contenido: Preface -- Part I Introduction -- Chapter1 Introduction -- Chapter2 Development of Carbohydrate Nomenclature and Representation -- Part II Monosaccharide and glycan structures -- Chapter 3 Translation and validation of carbohydrate residue names with MonosaccharideDB routines -- Chapter4 Using GlyTouCan version 1.0: The first international glycan structure repository -- Chapter5 CARBOHYDRATE STRUCTURE DATABASE (CSDB) – examples of usage -- Part III Glyco-related genes and proteins -- Chapter6 The CAZy Database / The Carbohydrate-Active Enzyme (CAZy) database: principles and usage guidelines -- Chapter7 Glyco3D: A Suite of Inter-linked Databases of 3D Structures of Complex Carbohydrates, Lectins, Antibodies and Glycosyltransferases -- Chapter8 GlycoGene Database (GGDB) on the Semantic Web -- Chapter9 KEGG GLYCAN Database -- Part IV Glycoproteomics data -- Chapter10 Exploring the UniCarbKB Database -- Chapter11 GlycoProtDB –A database of glycoproteins mapped with actual glycosylation sites identified by mass spectrometry -- Part V Glycan interactions -- Chapter12 GlycoEpitope -- Chapter13 SugarBindDB -- Chapter14 PAConto - RDF representation of PACDB data and Ontology of Infectious Diseases known to be related to Glycan Binding -- Part VI Glycan data analysis -- Chapter15 RINGS: a web resource of tools for analyzing glycomics data -- Chapter16 Glycan data retrieval and analysis using GLYCOSCIENCES.de applications -- Chapter17 Glycobiology meets the Semantic Web. Tipo de medio : Computadora Summary : This book provides glycoscientists with a handbook of useful databases that can be applied to glycoscience research. Although many databases are now publicly available, one of the hurdles for their users is the learning curve required to effectively utilize those databases. Therefore, this book not only describes the existing databases, but also provides tips on how to obtain the target data. That is, because many databases provide a variety of data that could be obtained from different perspectives, each chapter provides users with potential biological questions that can be answered by a particular database and step-by-step instructions, with figures, on how to obtain that data. Troubleshooting tips are also provided to aid users encountering problems that can be predicted when using these databases. Moreover, contact information for each database is provided in case unexpected issues arise. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] A Practical Guide to Using Glycomics Databases [documento electrónico] / Aoki-Kinoshita, Kiyoko F., . - 1 ed. . - Tokyo [Japón] : Springer, 2017 . - IX, 370 p. 226 ilustraciones, 178 ilustraciones en color.
ISBN : 978-4-431-56454-6
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Bioinformática ProteÃnas BioquÃmica de proteÃnas Clasificación: 570.285 Resumen: Este libro proporciona a los glicocientÃficos un manual de bases de datos útiles que pueden aplicarse a la investigación de la glicociencia. Aunque muchas bases de datos ahora están disponibles públicamente, uno de los obstáculos para sus usuarios es la curva de aprendizaje necesaria para utilizarlas de manera efectiva. Por lo tanto, este libro no solo describe las bases de datos existentes, sino que también brinda consejos sobre cómo obtener los datos de destino. Es decir, debido a que muchas bases de datos proporcionan una variedad de datos que podrÃan obtenerse desde diferentes perspectivas, cada capÃtulo proporciona a los usuarios preguntas biológicas potenciales que pueden ser respondidas por una base de datos particular e instrucciones paso a paso, con figuras, sobre cómo obtenerlos. esos datos. También se proporcionan sugerencias para ayudar a los usuarios a encontrar problemas que pueden predecirse al utilizar estas bases de datos. Además, se proporciona información de contacto para cada base de datos en caso de que surjan problemas inesperados. Nota de contenido: Preface -- Part I Introduction -- Chapter1 Introduction -- Chapter2 Development of Carbohydrate Nomenclature and Representation -- Part II Monosaccharide and glycan structures -- Chapter 3 Translation and validation of carbohydrate residue names with MonosaccharideDB routines -- Chapter4 Using GlyTouCan version 1.0: The first international glycan structure repository -- Chapter5 CARBOHYDRATE STRUCTURE DATABASE (CSDB) – examples of usage -- Part III Glyco-related genes and proteins -- Chapter6 The CAZy Database / The Carbohydrate-Active Enzyme (CAZy) database: principles and usage guidelines -- Chapter7 Glyco3D: A Suite of Inter-linked Databases of 3D Structures of Complex Carbohydrates, Lectins, Antibodies and Glycosyltransferases -- Chapter8 GlycoGene Database (GGDB) on the Semantic Web -- Chapter9 KEGG GLYCAN Database -- Part IV Glycoproteomics data -- Chapter10 Exploring the UniCarbKB Database -- Chapter11 GlycoProtDB –A database of glycoproteins mapped with actual glycosylation sites identified by mass spectrometry -- Part V Glycan interactions -- Chapter12 GlycoEpitope -- Chapter13 SugarBindDB -- Chapter14 PAConto - RDF representation of PACDB data and Ontology of Infectious Diseases known to be related to Glycan Binding -- Part VI Glycan data analysis -- Chapter15 RINGS: a web resource of tools for analyzing glycomics data -- Chapter16 Glycan data retrieval and analysis using GLYCOSCIENCES.de applications -- Chapter17 Glycobiology meets the Semantic Web. Tipo de medio : Computadora Summary : This book provides glycoscientists with a handbook of useful databases that can be applied to glycoscience research. Although many databases are now publicly available, one of the hurdles for their users is the learning curve required to effectively utilize those databases. Therefore, this book not only describes the existing databases, but also provides tips on how to obtain the target data. That is, because many databases provide a variety of data that could be obtained from different perspectives, each chapter provides users with potential biological questions that can be answered by a particular database and step-by-step instructions, with figures, on how to obtain that data. Troubleshooting tips are also provided to aid users encountering problems that can be predicted when using these databases. Moreover, contact information for each database is provided in case unexpected issues arise. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
TÃtulo : A Quest Towards a Mathematical Theory of Living Systems Tipo de documento: documento electrónico Autores: Bellomo, Nicola, ; Bellouquid, Abdelghani, ; Gibelli, Livio, ; Outada, Nisrine, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2017 Número de páginas: XIII, 181 p. 30 ilustraciones, 27 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-319-57436-3 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Biomatemáticas Modelos matemáticos teorÃa del sistema BiologÃa Matemática y Computacional Modelización Matemática y Matemática Industrial Sistemas complejos Clasificación: 570.285 Resumen: Esta monografÃa tiene como objetivo sentar las bases para el diseño de un enfoque matemático unificado para el modelado y análisis de sistemas grandes y complejos compuestos de seres vivos que interactúan. Basándose en veinte años de investigación en diversos campos cientÃficos, explora cómo la teorÃa cinética matemática y la teorÃa de juegos evolutivos pueden usarse para comprender la compleja interacción entre las ciencias matemáticas y la dinámica de los sistemas vivos. Los autores esperan que esto contribuya al desarrollo de nuevas herramientas y estrategias, si no de una nueva teorÃa matemática. El primer capÃtulo analiza las caracterÃsticas principales de los sistemas vivos y describe una estrategia para su modelado. Los siguientes capÃtulos exploran algunos de los métodos necesarios para lograr esto en la práctica. El capÃtulo dos proporciona una breve introducción a la teorÃa cinética matemática de partÃculas clásicas, con especial énfasis en la ecuación de Boltzmann; También se tratan brevemente la ecuación de Enskog, los modelos de campo medio y los métodos de Monte Carlo. El CapÃtulo Tres utiliza conceptos de la teorÃa de juegos evolutivos para derivar estructuras matemáticas que sean capaces de capturar las caracterÃsticas de complejidad de las interacciones dentro de los sistemas vivos. Luego, el libro pasa a explorar las aplicaciones relevantes de estos métodos que potencialmente pueden usarse para derivar modelos especÃficos y utilizables. El modelado de sistemas sociales en diversos contextos es el tema del CapÃtulo Cinco, y en el CapÃtulo Seis se ofrece una visión general del modelado de la dinámica de multitudes, lo que demuestra cómo se puede utilizar este enfoque para modelar la dinámica de sistemas multicelulares. El capÃtulo final considera algunas aplicaciones adicionales antes de presentar una descripción general de los problemas abiertos. Luego, los autores ofrecen sus propias especulaciones sobre los caminos conceptuales que pueden conducir a una teorÃa matemática de los sistemas vivos con la esperanza de motivar futuras actividades de investigación en este campo. Una contribución verdaderamente única a la literatura existente, Una búsqueda hacia una teorÃa matemática de los sistemas vivos es un libro importante que sin duda tendrá una influencia significativa en las direcciones futuras del campo. Será de interés para biólogos matemáticos, biólogos de sistemas, biofÃsicos y otros investigadores que trabajan en la comprensión de las complejidades de los sistemas vivos. Nota de contenido: On the "Complex" Interplay between Mathematics and Living Systems -- A Brief Introduction to the Mathematical Kinetic Theory of Classical Particles -- On the Search for a Structure: Toward a Mathematical Theory to Model Living Systems -- From the Mathematical Theory to Applications -- Modeling Social Behavioral Dynamics -- Mathematical Models of Crowd Dynamics in Complex Venues -- On the Search for a Mathematical Theory of Living Systems. Tipo de medio : Computadora Summary : This monograph aims to lay the groundwork for the design of a unified mathematical approach to the modeling and analysis of large, complex systems composed of interacting living things. Drawing on twenty years of research in various scientific fields, it explores how mathematical kinetic theory and evolutionary game theory can be used to understand the complex interplay between mathematical sciences and the dynamics of living systems. The authors hope this will contribute to the development of new tools and strategies, if not a new mathematical theory. The first chapter discusses the main features of living systems and outlines a strategy for their modeling. The following chapters then explore some of the methods needed to potentially achieve this in practice. Chapter Two provides a brief introduction to the mathematical kinetic theory of classical particles, with special emphasis on the Boltzmann equation; the Enskog equation, meanfield models, and Monte Carlo methods are also briefly covered. Chapter Three uses concepts from evolutionary game theory to derive mathematical structures that are able to capture the complexity features of interactions within living systems. The book then shifts to exploring the relevant applications of these methods that can potentially be used to derive specific, usable models. The modeling of social systems in various contexts is the subject of Chapter Five, and an overview of modeling crowd dynamics is given in Chapter Six, demonstrating how this approach can be used to model the dynamics of multicellular systems. The final chapter considers some additional applications before presenting an overview of open problems. The authors then offer their own speculations on the conceptual paths that may lead to a mathematical theory of living systems hoping to motivate future research activity in the field. A truly unique contribution to the existing literature, A Quest Toward a Mathematical Theory of Living Systems is an important book that will no doubt have a significant influence on the future directions of the field. It will be of interest to mathematical biologists, systems biologists, biophysicists, and other researchers working on understanding the complexities of living systems. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] A Quest Towards a Mathematical Theory of Living Systems [documento electrónico] / Bellomo, Nicola, ; Bellouquid, Abdelghani, ; Gibelli, Livio, ; Outada, Nisrine, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2017 . - XIII, 181 p. 30 ilustraciones, 27 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-319-57436-3
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Biomatemáticas Modelos matemáticos teorÃa del sistema BiologÃa Matemática y Computacional Modelización Matemática y Matemática Industrial Sistemas complejos Clasificación: 570.285 Resumen: Esta monografÃa tiene como objetivo sentar las bases para el diseño de un enfoque matemático unificado para el modelado y análisis de sistemas grandes y complejos compuestos de seres vivos que interactúan. Basándose en veinte años de investigación en diversos campos cientÃficos, explora cómo la teorÃa cinética matemática y la teorÃa de juegos evolutivos pueden usarse para comprender la compleja interacción entre las ciencias matemáticas y la dinámica de los sistemas vivos. Los autores esperan que esto contribuya al desarrollo de nuevas herramientas y estrategias, si no de una nueva teorÃa matemática. El primer capÃtulo analiza las caracterÃsticas principales de los sistemas vivos y describe una estrategia para su modelado. Los siguientes capÃtulos exploran algunos de los métodos necesarios para lograr esto en la práctica. El capÃtulo dos proporciona una breve introducción a la teorÃa cinética matemática de partÃculas clásicas, con especial énfasis en la ecuación de Boltzmann; También se tratan brevemente la ecuación de Enskog, los modelos de campo medio y los métodos de Monte Carlo. El CapÃtulo Tres utiliza conceptos de la teorÃa de juegos evolutivos para derivar estructuras matemáticas que sean capaces de capturar las caracterÃsticas de complejidad de las interacciones dentro de los sistemas vivos. Luego, el libro pasa a explorar las aplicaciones relevantes de estos métodos que potencialmente pueden usarse para derivar modelos especÃficos y utilizables. El modelado de sistemas sociales en diversos contextos es el tema del CapÃtulo Cinco, y en el CapÃtulo Seis se ofrece una visión general del modelado de la dinámica de multitudes, lo que demuestra cómo se puede utilizar este enfoque para modelar la dinámica de sistemas multicelulares. El capÃtulo final considera algunas aplicaciones adicionales antes de presentar una descripción general de los problemas abiertos. Luego, los autores ofrecen sus propias especulaciones sobre los caminos conceptuales que pueden conducir a una teorÃa matemática de los sistemas vivos con la esperanza de motivar futuras actividades de investigación en este campo. Una contribución verdaderamente única a la literatura existente, Una búsqueda hacia una teorÃa matemática de los sistemas vivos es un libro importante que sin duda tendrá una influencia significativa en las direcciones futuras del campo. Será de interés para biólogos matemáticos, biólogos de sistemas, biofÃsicos y otros investigadores que trabajan en la comprensión de las complejidades de los sistemas vivos. Nota de contenido: On the "Complex" Interplay between Mathematics and Living Systems -- A Brief Introduction to the Mathematical Kinetic Theory of Classical Particles -- On the Search for a Structure: Toward a Mathematical Theory to Model Living Systems -- From the Mathematical Theory to Applications -- Modeling Social Behavioral Dynamics -- Mathematical Models of Crowd Dynamics in Complex Venues -- On the Search for a Mathematical Theory of Living Systems. Tipo de medio : Computadora Summary : This monograph aims to lay the groundwork for the design of a unified mathematical approach to the modeling and analysis of large, complex systems composed of interacting living things. Drawing on twenty years of research in various scientific fields, it explores how mathematical kinetic theory and evolutionary game theory can be used to understand the complex interplay between mathematical sciences and the dynamics of living systems. The authors hope this will contribute to the development of new tools and strategies, if not a new mathematical theory. The first chapter discusses the main features of living systems and outlines a strategy for their modeling. The following chapters then explore some of the methods needed to potentially achieve this in practice. Chapter Two provides a brief introduction to the mathematical kinetic theory of classical particles, with special emphasis on the Boltzmann equation; the Enskog equation, meanfield models, and Monte Carlo methods are also briefly covered. Chapter Three uses concepts from evolutionary game theory to derive mathematical structures that are able to capture the complexity features of interactions within living systems. The book then shifts to exploring the relevant applications of these methods that can potentially be used to derive specific, usable models. The modeling of social systems in various contexts is the subject of Chapter Five, and an overview of modeling crowd dynamics is given in Chapter Six, demonstrating how this approach can be used to model the dynamics of multicellular systems. The final chapter considers some additional applications before presenting an overview of open problems. The authors then offer their own speculations on the conceptual paths that may lead to a mathematical theory of living systems hoping to motivate future research activity in the field. A truly unique contribution to the existing literature, A Quest Toward a Mathematical Theory of Living Systems is an important book that will no doubt have a significant influence on the future directions of the field. It will be of interest to mathematical biologists, systems biologists, biophysicists, and other researchers working on understanding the complexities of living systems. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] A Systems Biology Approach to Advancing Adverse Outcome Pathways for Risk Assessment / Garcia-Reyero, Natà lia ; Murphy, Cheryl A.
TÃtulo : A Systems Biology Approach to Advancing Adverse Outcome Pathways for Risk Assessment Tipo de documento: documento electrónico Autores: Garcia-Reyero, Natà lia, ; Murphy, Cheryl A., Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2018 Número de páginas: XIV, 422 p. 77 ilustraciones, 64 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-319-66084-4 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Bioinformática FarmacologÃa BiologÃa Computacional y de Sistemas Clasificación: 570.285 Resumen: La presión social para minimizar el uso de pruebas con animales, la preocupación cada vez mayor por el bienestar animal y la necesidad de pruebas de toxicidad más relevantes para los humanos y más predictivas son algunos de los impulsores de nuevos enfoques para la detección quÃmica. Este libro se centra en La vÃa de resultados adversos, una construcción analÃtica que describe una cadena secuencial de eventos relacionados causalmente en diferentes niveles de organización biológica que conducen a un efecto ecotoxicológico o adverso para la salud. Si bien los esfuerzos anteriores se han centrado en una visión basada en vÃas toxicológicas para la evaluación de la salud humana y ecológica basándose en sistemas in vitro y modelos predictivos, el marco de la vÃa de resultados adversos proporciona una forma simplificada y estructurada de organizar la información toxicológica. En el libro, un enfoque de biologÃa de sistemas proporciona las herramientas para inferir, vincular y cuantificar los eventos de iniciación molecular y los eventos clave y las relaciones de eventos clave que conducen a resultados adversos. El avance de estas herramientas es crucial para la implementación exitosa de los POA con fines regulatorios. Nota de contenido: 1. Introduction -- Part I: Biology -- 2. "Non-model" species for eco and human health risk assessment -- 3.The fish embryo as a model for eco-toxicology and other potential models -- 4.Invertebrates/Plants -- 5.Behavioral/Neurobehavioral linkages to AOPs -- 6. Species extrapolation – common pathways etc -- 7.  Life History Evolution, incorporating evolutionary processes into AOPs to extrapolate -- Part II: Incorporating Biology into AOPs -- 8.Use of HTS assays to infer MIEs -- 9. AOP development: how to infer and define KER -- 10. The development of quantitative AOPs -- Part IV: Incorporating Modeling into AOPs.-11.Computational approaches (network science, etc) in AOPs: linking molecular datasets -- 12.Computational approaches : Dynamic Energy Budgets -- 13.  Modeling approaches in AOPs: extrapolation from individual to population -- 14.  Modeling approaches that augment AOPs: GUTS, QSAR, TKTD PBTKTD -- 15.  Exposure science and other stressors? How to incorporate -- 16.  AOP as an organizing framework and implications for biological science-AOP evolution -- 17. Use and acceptance of AOPs for regulatory applications, use of AOPs in human risk assessment, and legislation. . Tipo de medio : Computadora Summary : Social pressure to minimize the use of animal testing, the ever-increasing concern on animal welfare, and the need for more human-relevant and more predictive toxicity tests are some of the drivers for new approaches to chemical screening. This book focuses on The Adverse Outcome Pathway, an analytical construct that describes a sequential chain of causally linked events at different levels of biological organization that lead to an adverse health or ecotoxicological effect. While past efforts have focused on toxicological pathway-based vision for human and ecological health assessment relying on in vitro systems and predictive models, The Adverse Outcome Pathway framework provides a simplified and structured way to organize toxicological information. Within the book, a systems biology approach supplies the tools to infer, link, and quantify the molecular initiating events and the key events and key event relationships leading to adverse outcomes. The advancement of these tools is crucial for the successful implementation of AOPs for regulatory purposes. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] A Systems Biology Approach to Advancing Adverse Outcome Pathways for Risk Assessment [documento electrónico] / Garcia-Reyero, Natà lia, ; Murphy, Cheryl A., . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2018 . - XIV, 422 p. 77 ilustraciones, 64 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-319-66084-4
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Bioinformática FarmacologÃa BiologÃa Computacional y de Sistemas Clasificación: 570.285 Resumen: La presión social para minimizar el uso de pruebas con animales, la preocupación cada vez mayor por el bienestar animal y la necesidad de pruebas de toxicidad más relevantes para los humanos y más predictivas son algunos de los impulsores de nuevos enfoques para la detección quÃmica. Este libro se centra en La vÃa de resultados adversos, una construcción analÃtica que describe una cadena secuencial de eventos relacionados causalmente en diferentes niveles de organización biológica que conducen a un efecto ecotoxicológico o adverso para la salud. Si bien los esfuerzos anteriores se han centrado en una visión basada en vÃas toxicológicas para la evaluación de la salud humana y ecológica basándose en sistemas in vitro y modelos predictivos, el marco de la vÃa de resultados adversos proporciona una forma simplificada y estructurada de organizar la información toxicológica. En el libro, un enfoque de biologÃa de sistemas proporciona las herramientas para inferir, vincular y cuantificar los eventos de iniciación molecular y los eventos clave y las relaciones de eventos clave que conducen a resultados adversos. El avance de estas herramientas es crucial para la implementación exitosa de los POA con fines regulatorios. Nota de contenido: 1. Introduction -- Part I: Biology -- 2. "Non-model" species for eco and human health risk assessment -- 3.The fish embryo as a model for eco-toxicology and other potential models -- 4.Invertebrates/Plants -- 5.Behavioral/Neurobehavioral linkages to AOPs -- 6. Species extrapolation – common pathways etc -- 7.  Life History Evolution, incorporating evolutionary processes into AOPs to extrapolate -- Part II: Incorporating Biology into AOPs -- 8.Use of HTS assays to infer MIEs -- 9. AOP development: how to infer and define KER -- 10. The development of quantitative AOPs -- Part IV: Incorporating Modeling into AOPs.-11.Computational approaches (network science, etc) in AOPs: linking molecular datasets -- 12.Computational approaches : Dynamic Energy Budgets -- 13.  Modeling approaches in AOPs: extrapolation from individual to population -- 14.  Modeling approaches that augment AOPs: GUTS, QSAR, TKTD PBTKTD -- 15.  Exposure science and other stressors? How to incorporate -- 16.  AOP as an organizing framework and implications for biological science-AOP evolution -- 17. Use and acceptance of AOPs for regulatory applications, use of AOPs in human risk assessment, and legislation. . Tipo de medio : Computadora Summary : Social pressure to minimize the use of animal testing, the ever-increasing concern on animal welfare, and the need for more human-relevant and more predictive toxicity tests are some of the drivers for new approaches to chemical screening. This book focuses on The Adverse Outcome Pathway, an analytical construct that describes a sequential chain of causally linked events at different levels of biological organization that lead to an adverse health or ecotoxicological effect. While past efforts have focused on toxicological pathway-based vision for human and ecological health assessment relying on in vitro systems and predictive models, The Adverse Outcome Pathway framework provides a simplified and structured way to organize toxicological information. Within the book, a systems biology approach supplies the tools to infer, link, and quantify the molecular initiating events and the key events and key event relationships leading to adverse outcomes. The advancement of these tools is crucial for the successful implementation of AOPs for regulatory purposes. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
TÃtulo : Advanced Mathematical Methods in Biosciences and Applications Tipo de documento: documento electrónico Autores: Berezovskaya, Faina, ; Toni, Bourama, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2019 Número de páginas: XII, 264 p. 108 ilustraciones, 63 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-15715-9 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Biomatemáticas BiologÃa Matemática y Computacional Clasificación: 570.285 Resumen: Con contribuciones de expertos en biologÃa matemática e investigación biomédica, este volumen editado cubre un conjunto diverso de temas sobre métodos matemáticos y aplicaciones en las biociencias. Los temas se centran en métodos matemáticos avanzados, con capÃtulos sobre el análisis matemático del modelo de cuasiespecie, la ecuación de resonancia débil de Arnold, el análisis de bifurcación y el modelo de Tonnelier-Gerstner. Se pone especial énfasis en aplicaciones como la selección natural, la heterogeneidad de poblaciones, la ontogenia polivariante en plantas, la dinámica del cáncer y las soluciones analÃticas para pulsos viajeros y trenes de ondas en modelos neuronales. En este libro también se presenta un estudio sobre topologÃa cuasiperiódica. Este volumen, cuidadosamente revisado por pares, es adecuado para estudiantes interesados ​​en la investigación interdisciplinaria. Los investigadores en matemáticas aplicadas y biociencias encontrarán en este libro un recurso importante sobre los últimos avances en este campo. De acuerdo con la serie STEAM-H, los editores esperan inspirar comprensión y colaboración interdisciplinarias. Nota de contenido: Preface -- Berezovskaya F. and Karev G.: Arnold's Weak Resonance Equation as a model of Greek ornamental designs -- Bratus A., Novozhilov A. and Semenov, Y.: Rigorous mathematical analysis of the quasispecies model: From Manfred Eigen to recent developments -- De Leo, R.: A survey on quasiperiodic topology -- Karev, G.: Natural selection strategies in evolutionary game theory -- Karev, G. and Berezovskaya, F.: Struggle for Existence: the models for Darwinian and non-Darwinian selection -- Kareva, I.: Combining bifurcation analysis and population heterogeneity to ask meaningful questions -- Logofet, D: Polyvariant Ontogeny in Plants: A Primary Role of the Second Positive Eigenvalue -- Alvaro G. López, A.G., Seoane, J.M., Miguel A. F. Sanjuán, M.A.F.: Modelling cancer dynamics using cellular automata -- Medvinsky, A.: Recurrence as a basis for the assessment of predictability of the irregular population dynamics -- Nedorezov, L.V.: Total Analysis of PopulationTime Series: Estimation of Model Parameters and Identification of Population Dynamics Type -- Tsyganov M., Zemskov, E.P.: Analytical solutions for traveling pulses and wave trains in neural models: Excitable and oscillatory regimes -- Tyutyunov, Y., Zagrebneva, A.D., V.N.Govorukhin, L.I.Titova, L.I.: Numerical study of bifurcations occurring at fast time-scale in a predator-prey model with inertial prey-taxis -- Wirkus, S., Soho, E.: Within host dynamical immune response to co-infection with malaria and tuberculosis -- Index. Tipo de medio : Computadora Summary : Featuring contributions from experts in mathematical biology and biomedical research, this edited volume covers a diverse set of topics on mathematical methods and applications in the biosciences. Topics focus on advanced mathematical methods, with chapters on the mathematical analysis of the quasispecies model, Arnold's weak resonance equation, bifurcation analysis, and the Tonnelier-Gerstner model. Special emphasis is placed on applications such as natural selection, population heterogeneity, polyvariant ontogeny in plants, cancer dynamics, and analytical solutions for traveling pulses and wave trains in neural models. A survey on quasiperiodic topology is also presented in this book. Carefully peer-reviewed, this volume is suitable for students interested in interdisciplinary research. Researchers in applied mathematics and the biosciences will find this book an important resource on the latest developments in the field. In keeping with the STEAM-H series, the editors hope to inspire interdisciplinary understanding and collaboration. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Advanced Mathematical Methods in Biosciences and Applications [documento electrónico] / Berezovskaya, Faina, ; Toni, Bourama, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2019 . - XII, 264 p. 108 ilustraciones, 63 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-030-15715-9
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Biomatemáticas BiologÃa Matemática y Computacional Clasificación: 570.285 Resumen: Con contribuciones de expertos en biologÃa matemática e investigación biomédica, este volumen editado cubre un conjunto diverso de temas sobre métodos matemáticos y aplicaciones en las biociencias. Los temas se centran en métodos matemáticos avanzados, con capÃtulos sobre el análisis matemático del modelo de cuasiespecie, la ecuación de resonancia débil de Arnold, el análisis de bifurcación y el modelo de Tonnelier-Gerstner. Se pone especial énfasis en aplicaciones como la selección natural, la heterogeneidad de poblaciones, la ontogenia polivariante en plantas, la dinámica del cáncer y las soluciones analÃticas para pulsos viajeros y trenes de ondas en modelos neuronales. En este libro también se presenta un estudio sobre topologÃa cuasiperiódica. Este volumen, cuidadosamente revisado por pares, es adecuado para estudiantes interesados ​​en la investigación interdisciplinaria. Los investigadores en matemáticas aplicadas y biociencias encontrarán en este libro un recurso importante sobre los últimos avances en este campo. De acuerdo con la serie STEAM-H, los editores esperan inspirar comprensión y colaboración interdisciplinarias. Nota de contenido: Preface -- Berezovskaya F. and Karev G.: Arnold's Weak Resonance Equation as a model of Greek ornamental designs -- Bratus A., Novozhilov A. and Semenov, Y.: Rigorous mathematical analysis of the quasispecies model: From Manfred Eigen to recent developments -- De Leo, R.: A survey on quasiperiodic topology -- Karev, G.: Natural selection strategies in evolutionary game theory -- Karev, G. and Berezovskaya, F.: Struggle for Existence: the models for Darwinian and non-Darwinian selection -- Kareva, I.: Combining bifurcation analysis and population heterogeneity to ask meaningful questions -- Logofet, D: Polyvariant Ontogeny in Plants: A Primary Role of the Second Positive Eigenvalue -- Alvaro G. López, A.G., Seoane, J.M., Miguel A. F. Sanjuán, M.A.F.: Modelling cancer dynamics using cellular automata -- Medvinsky, A.: Recurrence as a basis for the assessment of predictability of the irregular population dynamics -- Nedorezov, L.V.: Total Analysis of PopulationTime Series: Estimation of Model Parameters and Identification of Population Dynamics Type -- Tsyganov M., Zemskov, E.P.: Analytical solutions for traveling pulses and wave trains in neural models: Excitable and oscillatory regimes -- Tyutyunov, Y., Zagrebneva, A.D., V.N.Govorukhin, L.I.Titova, L.I.: Numerical study of bifurcations occurring at fast time-scale in a predator-prey model with inertial prey-taxis -- Wirkus, S., Soho, E.: Within host dynamical immune response to co-infection with malaria and tuberculosis -- Index. Tipo de medio : Computadora Summary : Featuring contributions from experts in mathematical biology and biomedical research, this edited volume covers a diverse set of topics on mathematical methods and applications in the biosciences. Topics focus on advanced mathematical methods, with chapters on the mathematical analysis of the quasispecies model, Arnold's weak resonance equation, bifurcation analysis, and the Tonnelier-Gerstner model. Special emphasis is placed on applications such as natural selection, population heterogeneity, polyvariant ontogeny in plants, cancer dynamics, and analytical solutions for traveling pulses and wave trains in neural models. A survey on quasiperiodic topology is also presented in this book. Carefully peer-reviewed, this volume is suitable for students interested in interdisciplinary research. Researchers in applied mathematics and the biosciences will find this book an important resource on the latest developments in the field. In keeping with the STEAM-H series, the editors hope to inspire interdisciplinary understanding and collaboration. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
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