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Título : Advances in Computational Toxicology : Methodologies and Applications in Regulatory Science Tipo de documento: documento electrónico Autores: Hong, Huixiao, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2019 Número de páginas: XVII, 412 p. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-16443-0 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Química Farmacología Bioinformática Física y Teórica. Química Computacional Biología Computacional y de Sistemas Química Teórica Clasificación: 542.85 Resumen: Este libro proporciona una revisión exhaustiva de las metodologías tradicionales y de vanguardia que se utilizan actualmente en toxicología computacional y presenta específicamente su aplicación en la toma de decisiones regulatorias. Los autores de varias agencias gubernamentales como la FDA, NCATS y NIEHS, e institutos académicos comparten su experiencia del mundo real y analizan las prácticas más actuales en toxicología computacional y sus posibles aplicaciones en la ciencia regulatoria. Entre los temas cubiertos se encuentran modelos moleculares y simulaciones de dinámica molecular, métodos de aprendizaje automático para análisis de toxicidad, enfoques basados en redes para la evaluación de la toxicidad de fármacos y análisis toxicogenómicos. Al ofrecer una valiosa guía de referencia sobre toxicología computacional y aplicaciones potenciales en ciencia regulatoria, este libro atraerá a químicos, toxicólogos, investigadores de descubrimiento y desarrollo de fármacos, así como a científicos reguladores, revisores gubernamentales y estudiantes de posgrado interesados en este campo. Nota de contenido: Computational Toxicology Promotes Regulatory Science -- Tasks, Major Challenges and Emerging Modelling Methods for Computational Toxicology -- Xenobiotic Metabolism by Cytochrome P450s: Insights Gained from Molecular Simulations -- Applications of Molecular Modeling to Probe the Mechanism of Endocrine Disruptor Action -- Mixture Toxicity -- Towards reproducible in silico practice via OpenTox -- Combining Machine Learning and Multilayer Networks for Toxicity Prediction -- Matrix and tensor factorization for toxicity modelling -- Network-based In Silico Assessment of Drug Cardiotoxicity -- Mode-of-action-guided chemical toxicity prediction: A novel in silico approach for predictive toxicology -- Machine learning methods for toxicity analysis -- Predictive modeling of Tox21 data -- The NTP DrugMatrix Toxicogenomics Database and Analysis Tool -- Applications of Computational Toxicology for Risk Assessment of Food Ingredients and Indirect Food Additives -- In silico prediction of the point of departure (POD) with high throughput data -- The application of topic modeling on drug safety signal detection and analysis -- Molecular dynamics simulations and applications in computational toxicology -- Computational modeling for prediction of drug-induced liver injury in humans -- Genomics in vitro to in vivo extrapolation (GIVIVE) for drug safety evaluation. Tipo de medio : Computadora Summary : This book provides a comprehensive review of both traditional and cutting-edge methodologies that are currently used in computational toxicology and specifically features its application in regulatory decision making. The authors from various government agencies such as FDA, NCATS and NIEHS industry, and academic institutes share their real-world experience and discuss most current practices in computational toxicology and potential applications in regulatory science. Among the topics covered are molecular modeling and molecular dynamics simulations, machine learning methods for toxicity analysis, network-based approaches for the assessment of drug toxicity and toxicogenomic analyses. Offering a valuable reference guide to computational toxicology and potential applications in regulatory science, this book will appeal to chemists, toxicologists, drug discovery and development researchers as well as to regulatory scientists, government reviewers and graduate students interested in thisfield. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Advances in Computational Toxicology : Methodologies and Applications in Regulatory Science [documento electrónico] / Hong, Huixiao, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2019 . - XVII, 412 p.
ISBN : 978-3-030-16443-0
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Química Farmacología Bioinformática Física y Teórica. Química Computacional Biología Computacional y de Sistemas Química Teórica Clasificación: 542.85 Resumen: Este libro proporciona una revisión exhaustiva de las metodologías tradicionales y de vanguardia que se utilizan actualmente en toxicología computacional y presenta específicamente su aplicación en la toma de decisiones regulatorias. Los autores de varias agencias gubernamentales como la FDA, NCATS y NIEHS, e institutos académicos comparten su experiencia del mundo real y analizan las prácticas más actuales en toxicología computacional y sus posibles aplicaciones en la ciencia regulatoria. Entre los temas cubiertos se encuentran modelos moleculares y simulaciones de dinámica molecular, métodos de aprendizaje automático para análisis de toxicidad, enfoques basados en redes para la evaluación de la toxicidad de fármacos y análisis toxicogenómicos. Al ofrecer una valiosa guía de referencia sobre toxicología computacional y aplicaciones potenciales en ciencia regulatoria, este libro atraerá a químicos, toxicólogos, investigadores de descubrimiento y desarrollo de fármacos, así como a científicos reguladores, revisores gubernamentales y estudiantes de posgrado interesados en este campo. Nota de contenido: Computational Toxicology Promotes Regulatory Science -- Tasks, Major Challenges and Emerging Modelling Methods for Computational Toxicology -- Xenobiotic Metabolism by Cytochrome P450s: Insights Gained from Molecular Simulations -- Applications of Molecular Modeling to Probe the Mechanism of Endocrine Disruptor Action -- Mixture Toxicity -- Towards reproducible in silico practice via OpenTox -- Combining Machine Learning and Multilayer Networks for Toxicity Prediction -- Matrix and tensor factorization for toxicity modelling -- Network-based In Silico Assessment of Drug Cardiotoxicity -- Mode-of-action-guided chemical toxicity prediction: A novel in silico approach for predictive toxicology -- Machine learning methods for toxicity analysis -- Predictive modeling of Tox21 data -- The NTP DrugMatrix Toxicogenomics Database and Analysis Tool -- Applications of Computational Toxicology for Risk Assessment of Food Ingredients and Indirect Food Additives -- In silico prediction of the point of departure (POD) with high throughput data -- The application of topic modeling on drug safety signal detection and analysis -- Molecular dynamics simulations and applications in computational toxicology -- Computational modeling for prediction of drug-induced liver injury in humans -- Genomics in vitro to in vivo extrapolation (GIVIVE) for drug safety evaluation. Tipo de medio : Computadora Summary : This book provides a comprehensive review of both traditional and cutting-edge methodologies that are currently used in computational toxicology and specifically features its application in regulatory decision making. The authors from various government agencies such as FDA, NCATS and NIEHS industry, and academic institutes share their real-world experience and discuss most current practices in computational toxicology and potential applications in regulatory science. Among the topics covered are molecular modeling and molecular dynamics simulations, machine learning methods for toxicity analysis, network-based approaches for the assessment of drug toxicity and toxicogenomic analyses. Offering a valuable reference guide to computational toxicology and potential applications in regulatory science, this book will appeal to chemists, toxicologists, drug discovery and development researchers as well as to regulatory scientists, government reviewers and graduate students interested in thisfield. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
Título : Atomic Switch : From Invention to Practical Use and Future Prospects Tipo de documento: documento electrónico Autores: Aono, Masakazu, Mención de edición: 1 ed. Editorial: [s.l.] : Springer Fecha de publicación: 2020 Número de páginas: XI, 266 p. 150 ilustraciones, 112 ilustraciones en color. ISBN/ISSN/DL: 978-3-030-34875-5 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Química Microtecnología Sistemas micro electromecánicos Electroquímica Rieles Física Química Computacional Microsistemas y MEMS Metales y aleaciones Física Aplicada y Técnica Clasificación: 542.85 Resumen: Escrito por inventores y destacados expertos en este nuevo campo, el libro es el resultado del Simposio Internacional sobre "Interruptor Atómico: Invención, uso práctico y perspectivas futuras" que tuvo lugar en Tsukuba, Japón, del 27 al 28 de marzo de 2017. Los capítulos del libro Cubre las diferentes tendencias, desde la ciencia y la tecnología de los interruptores atómicos hasta sus aplicaciones como el procesamiento de información de tipo cerebral, la inteligencia artificial (IA) y nanodispositivos electrónicos funcionales completamente novedosos. También se describen los usos prácticos actuales del interruptor atómico. En comparación con el interruptor de transistor semiconductor convencional, el interruptor atómico es más compacto (~1/10) con un consumo de energía mucho menor (~1/10) y apenas influenciado por fuertes ruidos electromagnéticos y radiación, incluidos los rayos cósmicos en el espacio (~1/ 100). Como tal, este libro es de interés para investigadores, académicos y estudiantes dispuestos a explorar nuevos materiales, perfeccionar los métodos de nanofabricación y explorar arquitecturas de dispositivos nuevos y eficientes. Nota de contenido: Invention and Development of the Atomic Switch -- Pathway to Atomic-Switch Based Programmable Logic -- Atom-Switch FPGA: Application for IoT Sensing System in Space -- An Evaluation of Single Event Effects by Heavy Ion Irradiation on Atom Switch ROM / FPGA -- Nanoscale Electrochemical Studies: How can we Use the Atomic Switch -- Atomistic Simulations for Understanding Microscopic Mechanism of Resistive Switches -- Development of Three-terminal Atomic Switches and Related Topics -- Solid-Polymer-Electrolyte-Based Atomic Switches -- Nanoionic Devices for Physical Property Tuning and Enhancement -- Artificial Synapses Realized by Atomic Switch Technology -- Atomic Switch Networks for Neuroarchitectonics: Past, Present, Future -- A List of Papers Related to the Atomic Switch. Tipo de medio : Computadora Summary : Written by the inventors and leading experts of this new field, the book results from the International Symposium on "Atomic Switch: Invention, Practical use and Future Prospects" which took place in Tsukuba, Japan on March 27th - 28th, 2017. The book chapters cover the different trends from the science and technology of atomic switches to their applications like brain-type information processing, artificial intelligence (AI) and completely novel functional electronic nanodevices. The current practical uses of the atomic switch are also described. As compared with the conventional semiconductor transistor switch, the atomic switch is more compact (~1/10) with much lower power consumption (~1/10) and scarcely influenced by strong electromagnetic noise and radiation including cosmic rays in space (~1/100). As such, this book is of interest to researchers, scholars and students willing to explore new materials, to refine the nanofabrication methods and to explore new and efficient device architectures. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Atomic Switch : From Invention to Practical Use and Future Prospects [documento electrónico] / Aono, Masakazu, . - 1 ed. . - [s.l.] : Springer, 2020 . - XI, 266 p. 150 ilustraciones, 112 ilustraciones en color.
ISBN : 978-3-030-34875-5
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Palabras clave: Química Microtecnología Sistemas micro electromecánicos Electroquímica Rieles Física Química Computacional Microsistemas y MEMS Metales y aleaciones Física Aplicada y Técnica Clasificación: 542.85 Resumen: Escrito por inventores y destacados expertos en este nuevo campo, el libro es el resultado del Simposio Internacional sobre "Interruptor Atómico: Invención, uso práctico y perspectivas futuras" que tuvo lugar en Tsukuba, Japón, del 27 al 28 de marzo de 2017. Los capítulos del libro Cubre las diferentes tendencias, desde la ciencia y la tecnología de los interruptores atómicos hasta sus aplicaciones como el procesamiento de información de tipo cerebral, la inteligencia artificial (IA) y nanodispositivos electrónicos funcionales completamente novedosos. También se describen los usos prácticos actuales del interruptor atómico. En comparación con el interruptor de transistor semiconductor convencional, el interruptor atómico es más compacto (~1/10) con un consumo de energía mucho menor (~1/10) y apenas influenciado por fuertes ruidos electromagnéticos y radiación, incluidos los rayos cósmicos en el espacio (~1/ 100). Como tal, este libro es de interés para investigadores, académicos y estudiantes dispuestos a explorar nuevos materiales, perfeccionar los métodos de nanofabricación y explorar arquitecturas de dispositivos nuevos y eficientes. Nota de contenido: Invention and Development of the Atomic Switch -- Pathway to Atomic-Switch Based Programmable Logic -- Atom-Switch FPGA: Application for IoT Sensing System in Space -- An Evaluation of Single Event Effects by Heavy Ion Irradiation on Atom Switch ROM / FPGA -- Nanoscale Electrochemical Studies: How can we Use the Atomic Switch -- Atomistic Simulations for Understanding Microscopic Mechanism of Resistive Switches -- Development of Three-terminal Atomic Switches and Related Topics -- Solid-Polymer-Electrolyte-Based Atomic Switches -- Nanoionic Devices for Physical Property Tuning and Enhancement -- Artificial Synapses Realized by Atomic Switch Technology -- Atomic Switch Networks for Neuroarchitectonics: Past, Present, Future -- A List of Papers Related to the Atomic Switch. Tipo de medio : Computadora Summary : Written by the inventors and leading experts of this new field, the book results from the International Symposium on "Atomic Switch: Invention, Practical use and Future Prospects" which took place in Tsukuba, Japan on March 27th - 28th, 2017. The book chapters cover the different trends from the science and technology of atomic switches to their applications like brain-type information processing, artificial intelligence (AI) and completely novel functional electronic nanodevices. The current practical uses of the atomic switch are also described. As compared with the conventional semiconductor transistor switch, the atomic switch is more compact (~1/10) with much lower power consumption (~1/10) and scarcely influenced by strong electromagnetic noise and radiation including cosmic rays in space (~1/100). As such, this book is of interest to researchers, scholars and students willing to explore new materials, to refine the nanofabrication methods and to explore new and efficient device architectures. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
Título : Elementos de química grafo-teórica Tipo de documento: documento electrónico Autores: Carrasco Velar, Ramoín. Editorial: Ciudad Educativa Fecha de publicación: 2022 Número de páginas: 1 recurso en liÌ�nea (v, 108 paÌ�ginas) : Il.: ilustraciones ISBN/ISSN/DL: 978-1-5129-8861-1 Palabras clave: Chemistry Data processing. Computer science. QuiÌ�mica Proceso de datos. InformaÌ�tica. Clasificación: 542.85 Enlace de acceso : https://elibro-net.biblioproxy.umanizales.edu.co/es/lc/umanizales/titulos/218354 Elementos de química grafo-teórica [documento electrónico] / Carrasco Velar, Ramoín. . - Ciudad Educativa, 2022 . - 1 recurso en liÌ�nea (v, 108 paÌ�ginas) : : ilustraciones.
ISBN : 978-1-5129-8861-1
Palabras clave: Chemistry Data processing. Computer science. QuiÌ�mica Proceso de datos. InformaÌ�tica. Clasificación: 542.85 Enlace de acceso : https://elibro-net.biblioproxy.umanizales.edu.co/es/lc/umanizales/titulos/218354
Título : Photophysics and Photochemistry of a BODIPY‐Based Photosensitizer : Quantumchemical Simulations Tipo de documento: documento electrónico Autores: Ziems, Karl Michael, Mención de edición: 1 ed. Editorial: Berlin [Alemania] : Springer Fecha de publicación: 2019 Número de páginas: XIII, 139 p. 1 ilustraciones ISBN/ISSN/DL: 978-3-658-26188-7 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Química Química Física Fuentes de energía renovable Química Computacional Energía renovable Clasificación: 542.85 Resumen: Karl Michael Ziems investiga un colorante de boro dipirrometeno sustituido con meso-mesitil-2,6-yodo (BODIPY) con respecto a su funcionalidad como fotosensibilizador en una evolución de hidrógeno de dos componentes impulsada por la luz. El autor utiliza cálculos químicos cuánticos realizados en la teoría de la perturbación del espacio activo restringido de estados múltiples (TDDFT) y la densidad funcional dependiente del tiempo (TDDFT) hasta el nivel de teoría de segundo orden (MS-RASPT2). Se aclaran los procesos inducidos por la luz asociados con la formación del fotosensibilizador activo, es decir, mediante separación de cargas, así como la población de vías de degradación no deseadas. Por la presente, los dos mecanismos propuestos e investigados se basan en un efecto de átomo pesado del yodo en el colector singlete/triplete (excitado) y la reducción preliminar (del tinte) mediante un donante de electrones de sacrificio y la fotoexcitación posterior. Contenido Antecedentes teóricos de la química cuántica Detalles computacionales Resultados del mecanismo de átomos pesados Resultados del mecanismo de reducción química Grupos objetivo Académicos, investigadores y estudiantes en los campos de la química, especialmente la química computacional y la física El autor Karl Michael Ziems obtuvo su Maestría en Ciencias en Química en la Universidad Friedrich Schiller de Jena y realizó su tesis de maestría en el campo de la química cuántica. Actualmente estudia química teórica y computacional en la Universidad de Oxford. Nota de contenido: Theoretical Background of Quantum Chemistry -- Computational Details -- Results for Heavy Atom Mechanism -- Results for Chemical Reduction Mechanism. Tipo de medio : Computadora Summary : Karl Michael Ziems investigates a meso-mesityl-2,6-Iodine substituted Boron Dipyrromethene (BODIPY) dye regarding its functionality as photosensitizer in a two-component light-driven hydrogen evolution. The author uses quantum chemical calculations performed at the time-dependent density functional (TDDFT) and multi-state restricted active space perturbation theory through second-order (MS-RASPT2) level of theory. The light-induced processes associated with the formation of the active photosensitizer, i.e., by means of charge separation, as well as the population of undesired degradative pathways are elucidated. Hereby, the two proposed and investigated mechanisms are based on a heavy atom effect of iodine in the (excited) singlet/triplet manifold and preliminary reduction (of the dye) by a sacrificial electron donor and subsequent photoexcitation. Contents Theoretical Background of Quantum Chemistry Computational Details Results for Heavy Atom Mechanism Results for Chemical Reduction Mechanism Target Groups Academics, researchers, and students in the fields of chemistry, especially computational chemistry, and physics The Author Karl Michael Ziems obtained his Master of Science in chemistry at the Friedrich Schiller University Jena, and conducted his Master's thesis in the field of quantum chemistry. Currently, he studies theoretical and computational chemistry at the University of Oxford. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Photophysics and Photochemistry of a BODIPY‐Based Photosensitizer : Quantumchemical Simulations [documento electrónico] / Ziems, Karl Michael, . - 1 ed. . - Berlin [Alemania] : Springer, 2019 . - XIII, 139 p. 1 ilustraciones.
ISBN : 978-3-658-26188-7
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Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Química Química Física Fuentes de energía renovable Química Computacional Energía renovable Clasificación: 542.85 Resumen: Karl Michael Ziems investiga un colorante de boro dipirrometeno sustituido con meso-mesitil-2,6-yodo (BODIPY) con respecto a su funcionalidad como fotosensibilizador en una evolución de hidrógeno de dos componentes impulsada por la luz. El autor utiliza cálculos químicos cuánticos realizados en la teoría de la perturbación del espacio activo restringido de estados múltiples (TDDFT) y la densidad funcional dependiente del tiempo (TDDFT) hasta el nivel de teoría de segundo orden (MS-RASPT2). Se aclaran los procesos inducidos por la luz asociados con la formación del fotosensibilizador activo, es decir, mediante separación de cargas, así como la población de vías de degradación no deseadas. Por la presente, los dos mecanismos propuestos e investigados se basan en un efecto de átomo pesado del yodo en el colector singlete/triplete (excitado) y la reducción preliminar (del tinte) mediante un donante de electrones de sacrificio y la fotoexcitación posterior. Contenido Antecedentes teóricos de la química cuántica Detalles computacionales Resultados del mecanismo de átomos pesados Resultados del mecanismo de reducción química Grupos objetivo Académicos, investigadores y estudiantes en los campos de la química, especialmente la química computacional y la física El autor Karl Michael Ziems obtuvo su Maestría en Ciencias en Química en la Universidad Friedrich Schiller de Jena y realizó su tesis de maestría en el campo de la química cuántica. Actualmente estudia química teórica y computacional en la Universidad de Oxford. Nota de contenido: Theoretical Background of Quantum Chemistry -- Computational Details -- Results for Heavy Atom Mechanism -- Results for Chemical Reduction Mechanism. Tipo de medio : Computadora Summary : Karl Michael Ziems investigates a meso-mesityl-2,6-Iodine substituted Boron Dipyrromethene (BODIPY) dye regarding its functionality as photosensitizer in a two-component light-driven hydrogen evolution. The author uses quantum chemical calculations performed at the time-dependent density functional (TDDFT) and multi-state restricted active space perturbation theory through second-order (MS-RASPT2) level of theory. The light-induced processes associated with the formation of the active photosensitizer, i.e., by means of charge separation, as well as the population of undesired degradative pathways are elucidated. Hereby, the two proposed and investigated mechanisms are based on a heavy atom effect of iodine in the (excited) singlet/triplet manifold and preliminary reduction (of the dye) by a sacrificial electron donor and subsequent photoexcitation. Contents Theoretical Background of Quantum Chemistry Computational Details Results for Heavy Atom Mechanism Results for Chemical Reduction Mechanism Target Groups Academics, researchers, and students in the fields of chemistry, especially computational chemistry, and physics The Author Karl Michael Ziems obtained his Master of Science in chemistry at the Friedrich Schiller University Jena, and conducted his Master's thesis in the field of quantum chemistry. Currently, he studies theoretical and computational chemistry at the University of Oxford. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
Título : Polarizable Embedding for the Algebraic-Diagrammatic Construction Scheme : Investigating Photoexcitations in Large Biomolecular Systems Tipo de documento: documento electrónico Autores: Scheurer, Maximilian, Mención de edición: 1 ed. Editorial: Berlin [Alemania] : Springer Fecha de publicación: 2020 Número de páginas: X, 97 p. 12 ilustraciones ISBN/ISSN/DL: 978-3-658-31281-7 Nota general: Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos. Idioma : Inglés (eng) Palabras clave: Química Física y Teórica. Química Inorgánica Química Física Química Computacional Química Teórica Clasificación: 542.85 Resumen: Maximilian Scheurer presenta un método para modelar estados excitados en entornos atomísticos y heterogéneos. El método utiliza el modelo de incrustación polarizable (PE) para imitar las interacciones electrostáticas y de polarización de una molécula con su entorno. Para el modelado de alto nivel de los estados excitados de la molécula, se emplea el esquema de construcción diagrama algebraico para el propagador de polarización (ADC). El trabajo presentado describe los fundamentos teóricos de PE y ADC y la combinación de ambos métodos, denominada PE-ADC. Se prueba la precisión de PE-ADC y se estudia la excitación de transferencia de carga (CT) en la proteína dodecina. Este libro presenta una elaboración exhaustiva del nuevo método PE-ADC y una aplicación de última generación de PE-ADC a un proceso fotobioquímico. Contenido Introducción completa a los modelos de incrustación polarizables Derivación del enfoque PE-ADC perturbativo y estudio de caso de referencia de un mecanismo de extinción de flavoproteínas Grupos objetivo Profesores y estudiantes de fotoquímica computacional Químicos computacionales en el campo del modelado de solventes El autor Maximilian Scheurer estudió Bioquímica y ahora es Estudiante de doctorado en el grupo de Química Teórica y Computacional del Prof. Dr. Andreas Dreuw en el Interdisciplinario de Computación Científica de la Universidad de Heidelberg, Alemania. Su principal foco de investigación es el desarrollo de métodos ab-initio para estados excitados, propiedades moleculares y la aplicación de dichos métodos a procesos fotoquímicos en sistemas biomoleculares. Nota de contenido: Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models -- Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark -- Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism. Tipo de medio : Computadora Summary : Maximilian Scheurer presents a method for modeling excited states in atomistic, heterogeneous environments. The method utilizes the polarizable embedding (PE) model to mimic electrostatic and polarization interactions of a molecule with its environment. For high-level modeling of the molecule's excited states, the algebraic-diagrammatic construction scheme for the polarization propagator (ADC) is employed. The presented work outlines the theoretical foundations of PE and ADC and the combination of both methods, termed PE-ADC. The accuracy of PE-ADC is tested, and the charge-transfer (CT) excitation in the dodecin protein is studied. This book presents a comprehensive elaboration on the new PE-ADC method and a state-of-the-art application of PE-ADC to a photo-biochemical process. Contents Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism Target Groups Lecturers and students in computational photochemistry Computational chemists in the field of solvent modeling The Author Maximilian Scheurer studied Biochemistry and is now a PhD student in the Theoretical and Computational Chemistry group of Prof. Dr. Andreas Dreuw at the Interdisciplinary for Scientific Computing at Heidelberg University, Germany. His main research focus is the development of ab-initio methods for excited states, molecular properties, and application of such methods to photochemical processes in biomolecular systems. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...] Polarizable Embedding for the Algebraic-Diagrammatic Construction Scheme : Investigating Photoexcitations in Large Biomolecular Systems [documento electrónico] / Scheurer, Maximilian, . - 1 ed. . - Berlin [Alemania] : Springer, 2020 . - X, 97 p. 12 ilustraciones.
ISBN : 978-3-658-31281-7
Libro disponible en la plataforma SpringerLink. Descarga y lectura en formatos PDF, HTML y ePub. Descarga completa o por capítulos.
Idioma : Inglés (eng)
Palabras clave: Química Física y Teórica. Química Inorgánica Química Física Química Computacional Química Teórica Clasificación: 542.85 Resumen: Maximilian Scheurer presenta un método para modelar estados excitados en entornos atomísticos y heterogéneos. El método utiliza el modelo de incrustación polarizable (PE) para imitar las interacciones electrostáticas y de polarización de una molécula con su entorno. Para el modelado de alto nivel de los estados excitados de la molécula, se emplea el esquema de construcción diagrama algebraico para el propagador de polarización (ADC). El trabajo presentado describe los fundamentos teóricos de PE y ADC y la combinación de ambos métodos, denominada PE-ADC. Se prueba la precisión de PE-ADC y se estudia la excitación de transferencia de carga (CT) en la proteína dodecina. Este libro presenta una elaboración exhaustiva del nuevo método PE-ADC y una aplicación de última generación de PE-ADC a un proceso fotobioquímico. Contenido Introducción completa a los modelos de incrustación polarizables Derivación del enfoque PE-ADC perturbativo y estudio de caso de referencia de un mecanismo de extinción de flavoproteínas Grupos objetivo Profesores y estudiantes de fotoquímica computacional Químicos computacionales en el campo del modelado de solventes El autor Maximilian Scheurer estudió Bioquímica y ahora es Estudiante de doctorado en el grupo de Química Teórica y Computacional del Prof. Dr. Andreas Dreuw en el Interdisciplinario de Computación Científica de la Universidad de Heidelberg, Alemania. Su principal foco de investigación es el desarrollo de métodos ab-initio para estados excitados, propiedades moleculares y la aplicación de dichos métodos a procesos fotoquímicos en sistemas biomoleculares. Nota de contenido: Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models -- Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark -- Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism. Tipo de medio : Computadora Summary : Maximilian Scheurer presents a method for modeling excited states in atomistic, heterogeneous environments. The method utilizes the polarizable embedding (PE) model to mimic electrostatic and polarization interactions of a molecule with its environment. For high-level modeling of the molecule's excited states, the algebraic-diagrammatic construction scheme for the polarization propagator (ADC) is employed. The presented work outlines the theoretical foundations of PE and ADC and the combination of both methods, termed PE-ADC. The accuracy of PE-ADC is tested, and the charge-transfer (CT) excitation in the dodecin protein is studied. This book presents a comprehensive elaboration on the new PE-ADC method and a state-of-the-art application of PE-ADC to a photo-biochemical process. Contents Comprehensive Introduction to Polarizable Embedding Models Derivation of the Perturbative PE-ADC Approach and Benchmark Case Study of a Flavoprotein Quenching Mechanism Target Groups Lecturers and students in computational photochemistry Computational chemists in the field of solvent modeling The Author Maximilian Scheurer studied Biochemistry and is now a PhD student in the Theoretical and Computational Chemistry group of Prof. Dr. Andreas Dreuw at the Interdisciplinary for Scientific Computing at Heidelberg University, Germany. His main research focus is the development of ab-initio methods for excited states, molecular properties, and application of such methods to photochemical processes in biomolecular systems. Enlace de acceso : https://link-springer-com.biblioproxy.umanizales.edu.co/referencework/10.1007/97 [...]
